RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 RUBCNLQ9H714 662 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 GPAMQ9HCL2 828 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 MKS1Q9NXB0 559 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 ACOT9Q9Y305 439 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 A0A087X1B8 175 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GTH9 108 aa11.76□□□□□ -0.53
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PRAME-212ENST00000485532 TMEM200CA6NKL6 621 aa11.76□□□□□ -0.53
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PRAME-212ENST00000485532 ZNF407Q9C0G0 2248 aa11.75□□□□□ -0.53
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PRAME-212ENST00000485532 KIR3DP1A8MWS1 328 aa11.75□□□□□ -0.53
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PRAME-212ENST00000485532 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 CD163Q86VB7 1156 aa11.75□□□□□ -0.53
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PRAME-212ENST00000485532 TMEM156Q8N614 296 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 ZNF321PQ8N8H1 164 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 OR52N2Q8NGI0 321 aa11.75□□□□□ -0.53
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PRAME-212ENST00000485532 DEPPQ9NTK1 212 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 EMCNQ9ULC0 261 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 PPT2Q9UMR5 302 aa11.75□□□□□ -0.53
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PRAME-212ENST00000485532 E9PLN8 166 aa11.74□□□□□ -0.53
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PRAME-212ENST00000485532 SH3BGRLO75368 114 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 OR2J2O76002 312 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 KLHL2O95198 593 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 TPOP07202 933 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 GSTA1P08263 222 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 EPORP19235 508 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 TFEBP19484 476 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 PTGS2P35354 604 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 LIM2P55344 173 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 IL20RBQ6UXL0 311 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 SNX31Q8N9S9 440 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 OR2L5Q8NG80 312 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 FAM57AQ8TBR7 257 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 EXT2Q93063 718 aa11.74□□□□□ -0.53
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