RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480155.1

SHOC2-204, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 2

Gene SHOC2, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-204	ENST00000480155	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		2.56	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	TEKT1	Q969V4	418 aa		2.56	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	AP2M1	Q96CW1	435 aa		2.56	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	PCED1B	Q96HM7	432 aa		2.56	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		2.56	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		2.56	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		2.56	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		2.56	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		2.56	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		2.56	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		2.56	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	CPQ	Q9Y646	472 aa		2.56	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	SYT7	O43581	403 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	RAD51D	O75771	328 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	IGKV3-15	P01624	115 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	FH	P07954	510 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	NUDT17	P0C025	328 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	OR9G9	P0C7N8	305 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	FAM200B	P0CF97	657 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	GLRA1	P23415	457 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	MATK	P42679	507 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	SLC1A6	P48664	564 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ST8SIA6	P61647	398 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ROR1	Q01973	937 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ARHGAP1	Q07960	439 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	LCP2	Q13094	533 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	SLC17A1	Q14916	467 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	SPHAR	Q15513	63 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	PCK2	Q16822	640 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	HECTD3	Q5T447	861 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	LRRC38	Q5VT99	294 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	RNLS	Q5VYX0	342 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	TMUB2	Q71RG4	321 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	NUP93	Q8N1F7	819 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	CD177	Q8N6Q3	437 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	AGAP11	Q8TF27	550 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	FAM46B	Q96A09	425 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	TRIM7	Q9C029	511 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	SP140L	Q9H930	580 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ARMCX1	Q9P291	453 aa		2.55	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ACE	P12821	1306 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155		H0Y626	953 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	SLC7A4	O43246	635 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ZNF253	O75346	499 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	CRCP	O75575	148 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ANXA9	O76027	345 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	OR6A2	O95222	327 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	B4GALT1	P15291	398 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	GPX3	P22352	226 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ELK3	P41970	407 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	SLC34A1	Q06495	639 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	VIT	Q6UXI7	678 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	SIAH3	Q8IW03	269 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	TRPV3	Q8NET8	790 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	GGH	Q92820	318 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	EPSTI1	Q96J88	318 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	RANBP9	Q96S59	729 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ZWILCH	Q9H900	591 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	CNIH4	Q9P003	139 aa		2.54	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155		A0A0U1RQK1	487 aa		2.53	□□□□□ -2
SHOC2-204	ENST00000480155	ZNF320	A2RRD8	509 aa		2.53	□□□□□ -2

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