RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 MYOTQ9UBF9 498 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 LRRC14BA6NHZ5 514 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 C17orf105B2RV13 164 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 PLPP1O14494 284 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 STX16O14662 325 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 DYRK3O43781 588 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 SMIM24O75264 130 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 ZNF24P17028 368 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 RPTNQ6XPR3 784 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 SIAH3Q8IW03 269 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 CNPY4Q8N129 248 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 GHDCQ8N2G8 530 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 ASB15Q8WXK1 588 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 SCYL1Q96KG9 808 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 PPT2Q9UMR5 302 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 A8MVJ9 347 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 PEX1O43933 1283 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 OR2J2O76002 312 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 COL8A1P27658 744 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 DCTP40126 519 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 STT3AP46977 705 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 CCNG1P51959 295 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 TNFRSF17Q02223 184 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 SULF2Q8IWU5 870 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 IFT20Q8IY31 132 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 RNF175Q8N4F7 328 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 DCAKDQ8WVC6 231 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 PHF21BQ96EK2 531 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 ART5Q96L15 291 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 DGAT2Q96PD7 388 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 SERPINI1Q99574 410 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 NTMT1Q9BV86 223 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 OR8D2Q9GZM6 311 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 ZNF358Q9NW07 568 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 HPF1Q9NWY4 346 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 XPR1Q9UBH6 696 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 RNF11Q9Y3C5 154 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 TMEM200CA6NKL6 621 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 OR7A17O14581 309 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 PROM1O43490 865 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 FGF17O60258 216 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 WISP2O76076 250 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 ABHD2P08910 425 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 MEOX1P50221 254 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 RNF4P78317 190 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 PLIN5Q00G26 463 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 ART3Q13508 389 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 ZNF787Q6DD87 383 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 MTBPQ96DY7 904 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 CCDC120Q96HB5 630 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 RASL10BQ96S79 203 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 WDR41Q9HAD4 459 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 PCTPQ9UKL6 214 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 A0A0A6YYD5 115 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-205ENST00000467594 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms