RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC26A5P58743 744 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FOLH1Q04609 750 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TGM3Q08188 693 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC13A2Q13183 592 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NSDHLQ15738 373 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BTBD16Q32M84 506 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CHSY3Q70JA7 882 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MED25Q71SY5 747 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NDUFAF7Q7L592 441 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLPP5Q8NEB5 264 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDC26Q8NHZ8 85 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC126Q96EE4 140 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPP1R36Q96LQ0 422 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C3orf30Q96M34 536 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM117AQ9C073 453 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RIC8BQ9NVN3 520 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PTGFRNQ9P2B2 879 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HEY2Q9UBP5 337 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DNAJC13O75165 2243 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MED12Q93074 2177 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A088AWK7 358 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CRCPO75575 148 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRT6AP02538 564 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRT6BP04259 564 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SERPINE1P05121 402 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IL3P08700 152 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CD63P08962 238 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LINC00032P0C843 101 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TACR1P25103 407 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HPDP32754 393 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRT6CP48668 564 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PGDP52209 483 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RRADP55042 308 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SKP1P63208 163 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MYBPC3Q14896 1274 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LTB4RQ15722 352 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UGT3A2Q3SY77 523 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CYP20A1Q6UW02 462 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LINC00696Q6ZRV3 163 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPR180Q86V85 440 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NUDCD3Q8IVD9 361 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF781Q8N8C0 355 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 Q8NA96 180 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLHC1Q8NHS4 586 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NUDT8Q8WV74 236 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CHTF18Q8WVB6 975 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 METTL21AQ8WXB1 218 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SH3GL2Q99962 352 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ADNPQ9H2P0 1102 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BRF2Q9HAW0 419 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCNX3Q9H6A9 2034 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TM9SF1O15321 606 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PROM1O43490 865 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ULK1O75385 1050 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZWINTO95229 277 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DDAH2O95865 285 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLPSP04118 112 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SERPINA7P05543 415 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CT62P0C5K7 136 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UROSP10746 265 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SOX18P35713 384 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAPK12P53778 367 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPL38P63173 70 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms