RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2M2Q96R28 347 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL4I1Q96RQ9 567 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAD9AQ99638 391 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 BRD8Q9H0E9 1235 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 LMAN2LQ9H0V9 348 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 EPHX3Q9H6B9 360 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRPV4Q9HBA0 871 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 FANCLQ9NW38 375 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM206AQ9NX38 181 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC5A4Q9NY91 659 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYO1AQ9UBC5 1043 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 COPG2Q9UBF2 871 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 GMEB2Q9UKD1 530 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 C22orf24Q9Y442 160 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPEF1Q9Y4P9 236 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 LAMA4Q16363 1823 aa-1.47□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCN2AQ99250 2005 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A0J9YXY3 114 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 GJE1A6NN92 205 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR7A17O14581 309 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF263O14978 683 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEPT4O43236 478 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLPP2O43688 288 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIP5K1CO60331 668 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYTIPO60759 359 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 BAG3O95817 575 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADRA2AP08913 450 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 NR2F1P10589 423 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERPINA4P29622 427 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHMT2P34897 504 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 UGT1A5P35504 534 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAGEA6P43360 314 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 GABRB2P47870 512 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 POU3F4P49335 361 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 GDI2P50395 445 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 PITPNAQ00169 270 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBL2Q08999 1139 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTC22Q5TAA0 569 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC181Q5TID7 509 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPRG1Q6ZUI0 275 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 LCA10Q71F78 164 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 GALNT5Q7Z7M9 940 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC190Q86UF4 302 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 GALNT13Q8IUC8 556 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALLCQ8N6M5 410 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC52Q8N7C0 313 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAGEB6Q8N7X4 407 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCEANCQ8N8B7 351 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEX19Q8NA77 164 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5M1Q8NGP8 315 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHAC2Q8WUX2 184 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC107Q8WV48 283 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRTOMTQ8WZ04 291 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 C5orf30Q96GV9 206 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 RTKNQ9BST9 563 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGXT2Q9BYV1 514 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM129AQ9BZQ8 928 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CARD9Q9H257 536 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM60Q9H2L4 133 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCLRE1BQ9H816 532 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADGRL4Q9HBW9 690 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 NEK6Q9HC98 313 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFAF4Q9P032 175 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 HACD3Q9P035 362 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 L1RE1Q9UN81 338 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 SIGLEC9Q9Y336 463 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM17Q9Y577 477 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALPK2Q86TB3 2170 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A087WZ39 114 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A087WZY1 265 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGEF35A5YM69 484 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 NKX6-3A6NJ46 265 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 YDJCA8MPS7 323 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 A8MUA0 341 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 C4orf51C9J302 202 aa-1.49□□□□□ -2.65
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