RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 GEMP55040 296 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 SRPXP78539 464 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 PDE7AQ13946 482 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 EPC2Q52LR7 807 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 DOK6Q6PKX4 331 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 Q6ZRG5 221 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 MCM10Q7L590 875 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 ITIH5Q86UX2 942 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC22A16Q86VW1 577 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 RNF130Q86XS8 419 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 PHC2Q8IXK0 858 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF440Q8IYI8 595 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 CHPT1Q8WUD6 406 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATF6BQ99941 703 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 DCTN5Q9BTE1 182 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 LRRC61Q9BV99 259 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 IL1RAPQ9NPH3 570 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 PIGVQ9NUD9 493 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRIM10Q9UDY6 481 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 IL19Q9UHD0 177 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 A0A1W2PPR1 153 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 OR5H15A6NDH6 313 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF724A8MTY0 619 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 ARHGEF33A8MVX0 844 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 TLR4O00206 839 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 PI15O43692 258 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 LRP3O75074 770 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 IGHG1P01857 330 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 LYNP07948 512 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 FHP07954 510 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCP11498 1178 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 B4GALT1P15291 398 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 EZRP15311 586 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 AREGP15514 252 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 CD1DP15813 335 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 FERP16591 822 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 FCARP24071 287 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 CASP9P55211 416 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 RBBP4Q09028 425 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF146Q15072 292 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRT31Q15323 416 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 ECSCRQ19T08 205 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 WSCD2Q2TBF2 565 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 MPPE1Q53F39 396 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 MUC21Q5SSG8 566 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM182AQ5T1J6 154 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 NKAIN2Q5VXU1 208 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 PAQR6Q6TCH4 344 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 DLEU7Q6UYE1 221 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 LMNTD2Q8IXW0 634 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 PARP8Q8N3A8 854 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 FBXW8Q8N3Y1 598 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 GVQW1Q8N7I0 195 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 SNED1Q8TER0 1413 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 NPRL2Q8WTW4 380 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 UBTD2Q8WUN7 234 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCED1BQ96HM7 432 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRAM1Q96QH2 718 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRIM15Q9C019 465 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 GANQ9H2C0 597 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 DPEP3Q9H4B8 488 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 THAP9Q9H5L6 903 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 MOB1AQ9H8S9 216 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 MARCH7Q9H992 704 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 DEPPQ9NTK1 212 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 CTSZQ9UBR2 303 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRSS21Q9Y6M0 314 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 WDR81Q562E7 1941 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 SH3PXD2BA1X283 911 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 ASB14A6NK59 587 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMCO5BA8MYB1 307 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 FBP2O00757 339 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATP6V1G1O75348 118 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 CSO75390 466 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANXA9O76027 345 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms