RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384105.1

RNU6V-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear variant sequence with SNRPE pseudogene sequence, humanhuman

BASIC

Gene RNU6V, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6V-201ENST00000384105 NXPH4O95158 308 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SLU7O95391 586 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 STAMBPO95630 424 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 OLFM2O95897 454 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LGI1O95970 557 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PTTG1O95997 202 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LHBP01229 141 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PRH1P02810 166 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 OPN1LWP04000 364 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TFF1P04155 84 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SEMG1P04279 462 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PYGLP06737 847 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 KRT16P08779 473 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 HOXB5P09067 269 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SBK2P0C263 348 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 OR4Q2P0C623 313 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TPBGLP0DKB5 382 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SKILP12757 684 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DEFA4P12838 97 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TCF4P15884 667 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NCK1P16333 377 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PRLRP16471 622 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GABRG2P18507 467 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TSPAN8P19075 237 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 EDN2P20800 178 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 IDSP22304 550 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ME2P23368 584 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PRTN3P24158 256 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CHMLP26374 656 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DPP4P27487 766 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LOXP28300 417 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CD34P28906 385 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CD1CP29017 333 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CA8P35219 290 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NF2P35240 595 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 HMGCLP35914 325 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 RPL4P36578 427 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ACVR1BP36896 505 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 VHLP40337 213 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CRATP43155 626 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MAGEA9P43362 315 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 QARSP47897 775 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SUOXP51687 545 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 UBE2E1P51965 193 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ATP5J2P56134 94 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 EVCP57679 992 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 KCNK10P57789 538 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 RHBDL3P58872 404 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CSNK2BP67870 215 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SLC35A2P78381 396 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 XIAPP98170 497 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ROR1Q01973 937 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DHODHQ02127 395 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PRKCEQ02156 737 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF45Q02386 682 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ACY1Q03154 408 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 RELAQ04206 551 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 FMODQ06828 376 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MCL1Q07820 350 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TGM3Q08188 693 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 BAMBIQ13145 260 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MAMLD1Q13495 774 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TRPC3Q13507 836 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 FAM53BQ14153 422 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GRB14Q14449 540 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 KIAA0040Q15053 153 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PPP2R5BQ15173 497 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZMYND11Q15326 602 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LTB4RQ15722 352 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TAB1Q15750 504 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ACKR1Q16570 336 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CCL15Q16663 113 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GSG1Q2KHT4 349 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LETM2Q2VYF4 491 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GRAMD1BQ3KR37 738 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TMEM52BQ4KMG9 183 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 IQCCQ4KMZ1 466 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF542PQ5EBM4 170 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MDH1BQ5I0G3 518 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CBWD5Q5RIA9 395 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ARMC4Q5T2S8 1044 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 C6orf52Q5T4I8 152 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GORABQ5T7V8 394 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 Q5VV11 94 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 AGAP6Q5VW22 663 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 IL23RQ5VWK5 629 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 FAM46CQ5VWP2 391 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LEMD1Q68G75 181 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF544Q6NX49 715 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 C16orf87Q6PH81 154 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms