RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 SH3BP5O60239 455 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NMT2O60551 498 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SEC14L2O76054 403 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 FGGP02679 453 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 HMGN1P05114 100 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SERPINA6P08185 405 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TRAPPC2P0DI81 140 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TRAPPC2BP0DI82 140 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 IMPDH1P20839 514 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 IL10P22301 178 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 UGT2B10P36537 528 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 COILP38432 576 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CASP3P42574 277 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SLCO1A2P46721 670 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 RGS7P49802 495 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ARL4CP56559 192 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 FCHO2Q0JRZ9 810 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TEFQ10587 303 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM29Q14134 588 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 UBE4AQ14139 1066 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GK3PQ14409 553 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF846Q147U1 533 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CDK10Q15131 360 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 C2orf68Q2NKX9 166 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM16LQ309B1 348 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM35AQ53FP2 167 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 FGD3Q5JSP0 725 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PPM1LQ5SGD2 360 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 C12orf60Q5U649 245 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 FAM205BPQ63HN1 556 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 KSR2Q6VAB6 950 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CHST3Q7LGC8 479 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF677Q86XU0 584 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 SCYL3Q8IZE3 742 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SCML4Q8N228 414 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 KRT35Q92764 455 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 TMEM80Q96HE8 168 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GCNAQ96QF7 691 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NEK6Q9HC98 313 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SULT1B1O43704 296 aa3.32□□□□□ -1.88
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