RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363519.1

RNU6-509P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 509, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-509P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-509P-201ENST00000363519 PRRG4Q9BZD6 226 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 OR51J1Q9H342 316 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SH2D4AQ9H788 454 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 C3orf14Q9HBI5 128 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 MIEF1Q9NQG6 463 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 OLAHQ9NV23 265 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 IMPAD1Q9NX62 359 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 GDE1Q9NZC3 331 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 LUZP4Q9P127 313 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 CACNG2Q9Y698 323 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PARD3Q8TEW0 1356 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 USP24Q9UPU5 2620 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 A0A096LNJ9 63 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 B4DLN1 442 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 NPHP1O15259 732 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 AP5Z1O43299 807 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 USO1O60763 962 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PRAF2O60831 178 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ICOSLGO75144 302 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PTP4A3O75365 173 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PRAMEF12O95522 483 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SLC2A10O95528 541 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 TBX18O95935 607 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 LINGO3P0C6S8 592 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 GOT1P17174 413 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 IDSP22304 550 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 IGFBP5P24593 272 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 OTX2P32243 289 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 KIR3DL2P43630 455 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 XCR1P46094 333 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 OR1D4P47884 311 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 GPC3P51654 580 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 UCP2P55851 309 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 RHBDL3P58872 404 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 RPS8P62241 208 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 CACNG1Q06432 222 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 CNTN1Q12860 1018 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 HSPB3Q12988 150 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SLAQ13239 276 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 KCTD2Q14681 263 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 CRYMQ14894 314 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SLC17A1Q14916 467 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SLC10A1Q14973 349 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 BRD3Q15059 726 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 IGFBP7Q16270 282 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 KYAT1Q16773 422 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 MICAQ29983 383 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ZNF542PQ5EBM4 170 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 FGD3Q5JSP0 725 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PRR9Q5T870 116 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PLPP4Q5VZY2 271 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 TTC27Q6P3X3 843 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 Q6ZR03 302 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PRSS48Q7RTY5 328 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 CPLX4Q7Z7G2 160 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 HMGN2P46Q86SG4 172 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 NLRP14Q86W24 1093 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 CACUL1Q86Y37 369 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 TDHQ8IZJ6 230 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SAMD12Q8N8I0 201 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ANKRD42Q8N9B4 389 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SUMF2Q8NBJ7 301 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 CLEC1AQ8NC01 280 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 MDS2Q8NDY4 140 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 BBS1Q8NFJ9 593 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 IL17REQ8NFR9 667 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 C8orf46Q8TAG6 207 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 GPR148Q8TDV2 347 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ARNTL2Q8WYA1 636 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 RDH5Q92781 318 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 P2RX5Q93086 422 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 C7orf26Q96N11 449 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ANKRD27Q96NW4 1050 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SEPHS2Q99611 448 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 NRTNQ99748 197 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 LZTS2Q9BRK4 669 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms