RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 DHCR24Q15392 516 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 C6orf136Q5SQH8 315 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF783Q6ZMS7 281 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 CSNK1A1LQ8N752 337 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 OR51A7Q8NH64 312 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 FBXL8Q96CD0 374 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF382Q96SR6 550 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 PIK3C2AO00443 1686 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 TRAV6A0A075B6T7 132 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 ABRAXAS2Q15018 415 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 SFT2D3Q587I9 215 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 DPH7Q9BTV6 452 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 STC2O76061 302 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM236Q5W0B7 351 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 CNIH3Q8TBE1 160 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM234Q8WY98 164 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 IL23AQ9NPF7 189 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 OR2B3O76000 313 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 MATN2O00339 956 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 CD72P21854 359 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF226Q9NYT6 803 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 ASB12Q8WXK4 309 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 PHC1P78364 1004 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 NR4A3Q92570 626 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 CDKL4Q5MAI5 379 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 GRIA2P42262 883 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 SEC14L5O43304 696 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 F8A1P23610 371 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 STOMP27105 288 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 GNRHRP30968 328 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 SLC15A1P46059 708 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 GALK2Q01415 458 aa21.45■■□□□ 1.02
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