RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 C2orf74A8MZ97 194 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 B4DGG1 531 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 E2F6O75461 281 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 PTGER1P34995 402 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 BLKP51451 505 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 DSTNP60981 165 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 PPP1CAP62136 330 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 RGS1Q08116 209 aa16.94■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa16.94■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 EHD3Q9NZN3 535 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 ABCA7Q8IZY2 2146 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 STK25O00506 426 aa16.94■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.35e-18■■□□□ 11.9
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ACTB-201ENST00000331789 NEUROD4Q9HD90 331 aa16.94■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 MYO1GB0I1T2 1018 aa16.93■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 C8orf89P0DMQ9 161 aa16.93■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF438Q7Z4V0 828 aa16.93■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa16.93■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D17Q9HA65 648 aa16.93■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 PNPLA3Q9NST1 481 aa16.93■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa16.93■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 FAM221BA6H8Z2 402 aa16.92■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 TP53BP2Q13625 1128 aa16.92■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 FOXB2Q5VYV0 432 aa16.92■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 PSMA8Q8TAA3 256 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 RAB8BQ92930 207 aa16.92■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 CD320Q9NPF0 282 aa16.92■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 CCDC88CQ9P219 2028 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 DNAJB6O75190 326 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 CSF2P04141 144 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 SMIM10L1P0DMW3 83 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 NTSP30990 170 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 RGS19P49795 217 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 MAZP56270 477 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 SLC48A1Q6P1K1 146 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 HIPK1Q86Z02 1210 aa16.92■□□□□ 0.3
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