RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 PCNX2A6NKB5 2137 aa15.08■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF682O95780 498 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 TGFB1P01137 390 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF24P17028 368 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 DCTP40126 519 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP2R2BQ00005 443 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 TTC23Q5W5X9 447 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 OGFOD3Q6PK18 319 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 SPESP1Q6UW49 350 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 PTOV1Q86YD1 416 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 MPP4Q96JB8 637 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 TPT1P8Q9HAU6 139 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM118AQ9NWS6 357 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 SH3BP4Q9P0V3 963 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 ASF1AQ9Y294 204 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 PIPSLA2A3N6 862 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 OR52A4PA6NMU1 304 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 CKMT1AP12532 417 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 F3P13726 295 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 KDELR2P33947 212 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 CLCNKAP51800 687 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 ESRRGP62508 458 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 RPA4Q13156 261 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 CLCA4Q14CN2 919 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 C14orf28Q4W4Y0 310 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR155Q7Z3F1 870 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 ARL14Q8N4G2 192 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC37A2Q8TED4 501 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 RAD51AP1Q96B01 352 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 DMRT3Q9NQL9 472 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP6V1HQ9UI12 483 aa15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 A6NCN8 305 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 PRR19A6NJB7 356 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 CASC3O15234 703 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 KCNJ13O60928 360 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 PRKACGP22612 351 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 PPIBP23284 216 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 SHMT2P34897 504 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 MAGEA2P43356 314 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 DMPKQ09013 629 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 EPS8Q12929 822 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 CBX3Q13185 183 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 ZBED5Q49AG3 693 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 METRNLQ641Q3 311 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 ANKRD34AQ69YU3 496 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 COMMD6Q7Z4G1 85 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 PDZD3Q86UT5 571 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 HIPK1Q86Z02 1210 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF555Q8NEP9 628 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 OR5AR1Q8NGP9 310 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 C17orf50Q8WW18 174 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 CXorf40BQ96DE9 158 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 IL17FQ96PD4 163 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 MBOAT4Q96T53 435 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 OR51B5Q9H339 312 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 REEP4Q9H6H4 257 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 IL1RAPQ9NPH3 570 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 RPS6KA6Q9UK32 745 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 SH3GLB1Q9Y371 365 aa15.06■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 C1orf226A1L170 272 aa15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 SAP18O00422 153 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 CDK9P50750 372 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF763Q0D2J5 394 aa15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 C16orf72Q14CZ0 275 aa15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 PERM1Q5SV97 790 aa15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR141Q7Z602 305 aa15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 SLCO6A1Q86UG4 719 aa15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 WDR48Q8TAF3 677 aa15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 IFI44Q8TCB0 444 aa15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 SPATA9Q9BWV2 254 aa15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 SPNS1Q9H2V7 528 aa15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 LRIT1Q9P2V4 623 aa15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 VPS4AQ9UN37 437 aa15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 RNF215Q9Y6U7 377 aa15.05■□□□□ 0
TSNARE1-201ENST00000307180 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
TSNARE1-201ENST00000307180 GBAP04062 536 aa15.05■□□□□ -0
TSNARE1-201ENST00000307180 FTH1P19P0C7X4 201 aa15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms