RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303731.8

TRAPPC1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC1, Length 811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-201ENST00000303731 PAOXQ6QHF9 649 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 RGS9BPQ6ZS82 235 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 TEX9Q8N6V9 391 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 AGAP11Q8TF27 550 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 KCTD4Q8WVF5 259 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 ART5Q96L15 291 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 SGCZQ96LD1 299 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 SNX15Q9NRS6 342 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 APCP25054 2843 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 TMEM200CA6NKL6 621 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 H0YIV9 168 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 ACOT7O00154 380 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 KLK8O60259 260 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 LDB3O75112 727 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 KLHL2O95198 593 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 CLDN14O95500 239 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 MTHFD2P13995 350 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 COX6B1P14854 86 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 TYK2P29597 1187 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 PTGS2P35354 604 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 SERPINB8P50452 374 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 27.5
TRAPPC1-201ENST00000303731 TRADDQ15628 312 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 MDGA2Q7Z553 956 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 RELL1Q8IUW5 271 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 GOLM1Q8NBJ4 401 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 HUS1BQ8NHY5 278 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 SLC2A12Q8TD20 617 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 TANKQ92844 425 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 RASL10BQ96S79 203 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 OR8D2Q9GZM6 311 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 ACSS3Q9H6R3 686 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 ACTR8Q9H981 624 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 PSD3Q9NYI0 1048 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 TMCO1Q9UM00 188 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 A0A096LPK6 155 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 ESYT3A0FGR9 886 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 RTCAO00442 366 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 TNFRSF8P28908 595 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 STT3AP46977 705 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 HK2P52789 917 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 RNF4P78317 190 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 PLIN5Q00G26 463 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 TNFRSF17Q02223 184 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 PFKFB4Q16877 469 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 OPN5Q6U736 354 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 RTL4Q6ZR62 310 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 GK5Q6ZS86 529 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 TAOK1Q7L7X3 1001 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 GDF7Q7Z4P5 450 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 GPR180Q86V85 440 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 DOLPP1Q86YN1 238 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 MCEMP1Q8IX19 187 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 FAM57AQ8TBR7 257 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 DGAT2Q96PD7 388 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 DMRT3Q9NQL9 472 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 PLSCR2Q9NRY7 297 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 CSMD1Q96PZ7 3565 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 WWP2O00308 870 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 HS6ST1O60243 411 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 GRNP28799 593 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 PTGER1P34995 402 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 GMPRP36959 345 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 HSF1Q00613 529 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 IRF9Q00978 393 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 SLC7A5Q01650 507 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 SLAMF1Q13291 335 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 CUL3Q13618 768 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 GTF2H2Q13888 395 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 MPEG1Q2M385 716 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 CMPK2Q5EBM0 449 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 TMEM211Q6ICI0 200 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 IL20RBQ6UXL0 311 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 SLC22A16Q86VW1 577 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 NUBPLQ8TB37 319 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms