RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296130.4

CLEC3B-201, Transcript of C-type lectin domain family 3 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC3B, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3B-201ENST00000296130 HPF1Q9NWY4 346 aa26.89■■□□□ 1.9
CLEC3B-201ENST00000296130 MEMO1Q9Y316 297 aa26.89■■□□□ 1.9
CLEC3B-201ENST00000296130 MYO7BQ6PIF6 2116 aa26.89■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 TMEM200CA6NKL6 621 aa26.88■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 C17orf105B2RV13 164 aa26.88■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 H0YIV9 168 aa26.88■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 PRRG2O14669 202 aa26.88■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 OR2J2O76002 312 aa26.88■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 TUBB4AP04350 444 aa26.88■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 MMGT1Q8N4V1 131 aa26.88■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 TANKQ92844 425 aa26.88■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 OR8D2Q9GZM6 311 aa26.88■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 NINJ2Q9NZG7 142 aa26.88■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 PHF11Q9UIL8 331 aa26.88■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa26.88■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 ITPR2Q14571 2701 aa26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 TFECO14948 347 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 DYRK3O43781 588 aa26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 LDB3O75112 727 aa26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 MDGA2Q7Z553 956 aa26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 GPR180Q86V85 440 aa26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 MNS1Q8NEH6 495 aa26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 GPR78Q96P69 363 aa26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 DMRT3Q9NQL9 472 aa26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 COPS7AQ9UBW8 275 aa26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 TMCO1Q9UM00 188 aa26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 IKBKGQ9Y6K9 419 aa26.87■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 SAP18O00422 153 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 SH3BGRLO75368 114 aa26.86■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 RBP1P09455 135 aa26.86■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 GTF2H2Q13888 395 aa26.86■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa26.86■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 SLC2A12Q8TD20 617 aa26.86■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 VPS11Q9H270 941 aa26.86■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 IPPKQ9H8X2 491 aa26.86■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 ARHGAP10A1A4S6 786 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 INHBAP08476 426 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 HTR1EP28566 365 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 STT3AP46977 705 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 SERPINB9P50453 376 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 RNF4P78317 190 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 CUL3Q13618 768 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 IL20RBQ6UXL0 311 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 RGS9BPQ6ZS82 235 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 TAOK1Q7L7X3 1001 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 L3MBTL4Q8NA19 623 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 PSD4Q8NDX1 1056 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 SLC44A1Q8WWI5 657 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 SGCZQ96LD1 299 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 DGAT2Q96PD7 388 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 RASL10BQ96S79 203 aa26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 CACNA1DQ01668 2161 aa26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 E9PLN8 166 aa26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 WWP2O00308 870 aa26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 HK2P52789 917 aa26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 ADORA2A-AS1P86434 159 aa26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 PAOXQ6QHF9 649 aa26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 OPN5Q6U736 354 aa26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 DOLPP1Q86YN1 238 aa26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 LURAP1LQ8IV03 231 aa26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 ART5Q96L15 291 aa26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 VKORC1Q9BQB6 163 aa26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa26.83■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 PLPP1O14494 284 aa26.83■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 COL6A2P12110 1019 aa26.83■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 CNTFP26441 200 aa26.83■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 PTGS2P35354 604 aa26.83■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 MPEG1Q2M385 716 aa26.83■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 AGAP11Q8TF27 550 aa26.83■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 ISL2Q96A47 359 aa26.83■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 FMO2Q99518 471 aa26.83■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 PPT2Q9UMR5 302 aa26.83■■□□□ 1.89
CLEC3B-201ENST00000296130 PROM1O43490 865 aa26.82■■□□□ 1.88
CLEC3B-201ENST00000296130 HS6ST1O60243 411 aa26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms