RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 FAIM2Q9BWQ8 316 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 RHPN2P1A8MT19 583 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 GSTA4O15217 222 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 UMPSP11172 480 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 GABRA4P48169 554 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK9P50750 372 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TGM3Q08188 693 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 HSPB3Q12988 150 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 GATAD2AQ86YP4 633 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMA8Q8TAA3 256 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 C10orf90Q96M02 699 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 AMDHD1Q96NU7 426 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TGM7Q96PF1 710 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SEPHS2Q99611 448 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB33BQ9H082 229 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 GLIPR2Q9H4G4 154 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFRSF21O75509 655 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MT-ND1P03886 318 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 RETP07949 1114 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ETFAP13804 333 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ALOX12P18054 663 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 PTGER1P34995 402 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CRYBA2P53672 197 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 EPHA4P54764 986 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 LIM2P55344 173 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 OLR1P78380 273 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MLC1Q15049 377 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SFT2D3Q587I9 215 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MANEAQ5SRI9 462 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 C11orf74Q86VG3 221 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF130Q86XS8 419 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 NATD1Q8N6N6 113 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52N2Q8NGI0 321 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SERINC2Q96SA4 455 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CSF3RQ99062 836 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 EPHA6Q9UF33 1036 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 DAPP1Q9UN19 280 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GTQ1 180 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF860A6NHJ4 632 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 B4GAT1O43505 415 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TPST1O60507 370 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MED26O95402 600 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 GLB1P16278 677 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 PPIBP23284 216 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MTX3Q5HYI7 312 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ABHD13Q7L211 337 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 GALNT10Q86SR1 603 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIML2Q8N7C3 387 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SAP25Q8TEE9 199 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJC9Q8WXX5 260 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 NCSTNQ92542 709 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF681Q96N22 645 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SNX8Q9Y5X2 465 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM149AA5PLN7 773 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 URADA6NGE7 173 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 PATE3B3GLJ2 98 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 GUCY1B2O75343 617 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 UQCRC2P22695 453 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 NR1D2Q14995 579 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CEBPEQ15744 281 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 HLA-BQ31612 363 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5T3Q8NGG3 340 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXO30Q8TB52 745 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TCTN2Q96GX1 697 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SUSD2Q9UGT4 822 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CORO2BQ9UQ03 480 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TLCD2A6NGC4 264 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 PEX1O43933 1283 aa8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms