RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 OR1D5P58170 312 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ZXDAP98168 799 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 SPIDRQ14159 915 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 SLC9A5Q14940 896 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 KIR2DS5Q14953 304 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ZFP1Q6P2D0 407 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TRIM40Q6P9F5 258 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PAGE2Q7Z2X7 111 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ASPGQ86U10 573 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 FAM47BQ8NA70 645 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 OR2L5Q8NG80 312 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ZFP90Q8TF47 636 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ZUFSPQ96AP4 578 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PPP1R14BQ96C90 147 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TPD52L3Q96J77 140 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM45AQ9NWC5 275 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ANKMY1Q9P2S6 941 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ANAPC2Q9UJX6 822 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PADI4Q9UM07 663 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 OR5K3A6NET4 321 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PEX1O43933 1283 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 KDM1AO60341 852 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PRMT3O60678 531 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 GPR37L1O60883 481 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 GMNNO75496 209 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TP53BP2Q13625 1128 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PDE7AQ13946 482 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 RGNQ15493 299 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 LTB4RQ15722 352 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 DPY19L1Q2PZI1 675 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TMTC4Q5T4D3 741 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ARMC6Q6NXE6 501 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PIGKQ92643 395 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM9Q9P0T7 183 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 OAZ3Q9UMX2 235 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM131Q92545 1883 aa10.4□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 IL10P22301 178 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 RPS9P46781 194 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 PSMD7P51665 324 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 BNC1Q01954 994 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 HEPACAMQ14CZ8 416 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 SPDYE7PQ495Y7 208 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 TBPL2Q6SJ96 375 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 CALHM3Q86XJ0 350 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 PDSS2Q86YH6 399 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 ZZZ3Q8IYH5 903 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 TRPV3Q8NET8 790 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 OR5D16Q8NGK9 328 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 SLC22A18Q96BI1 424 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 KCNC2Q96PR1 638 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 EQTNQ9NQ60 294 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 TAS2R9Q9NYW1 312 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 ASB4Q9Y574 426 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 GMEB1Q9Y692 573 aa10.4□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 C7orf72A4D263 438 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 AQP12BA6NM10 295 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 hCG_2039718K7EN88 272 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 SGK494L7N484 410 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 PDPK1O15530 556 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 SEMA3DO95025 777 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 YAP1P46937 504 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 MVDP53602 400 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 RUNX2Q13950 521 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 GPR19Q15760 415 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 ANXA8L1Q5VT79 327 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 OOSP2Q86WS3 158 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 EPHX4Q8IUS5 362 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 AQP12AQ8IXF9 295 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 CBR4Q8N4T8 237 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 KAT2AQ92830 837 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 TRIM15Q9C019 465 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 ATAD3AQ9NVI7 634 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 LDB3O75112 727 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 PIAS2O75928 621 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 CCNDBP1O95273 360 aa10.39□□□□□ -0.75
GGPS1-201ENST00000282841 MED26O95402 600 aa10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms