RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 ETV3P41162 512 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 NOGQ13253 232 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ILKQ13418 452 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 HTR3DQ70Z44 454 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TRIM69Q86WT6 500 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 FAM181AQ8N9Y4 354 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 IGSF21Q96ID5 467 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 MND1Q9BWT6 205 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 WDR70Q9NW82 654 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PQY0 241 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PRB8 838 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SEMA7AO75326 666 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PDHA2P29803 388 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 OPRD1P41143 372 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RPS5P46782 204 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 DSTNP60981 165 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 MXD1Q05195 221 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ZNF91Q05481 1191 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RUNX1T1Q06455 604 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 C12orf73Q69YU5 71 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 REPS1Q96D71 796 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RNF170Q96K19 258 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 MYNNQ9NPC7 610 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.22□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CTSAP10619 480 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TBPL1P62380 186 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TRIM60Q495X7 471 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 Q6ZVU0 165 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PHC2Q8IXK0 858 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 MMP21Q8N119 569 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ZNF480Q8WV37 535 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 MIXL1Q9H2W2 232 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ABCB9Q9NP78 766 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 GULP1Q9UBP9 304 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SSR3Q9UNL2 185 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PLXNA2O75051 1894 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ZNF197O14709 1029 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PLD2O14939 933 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CDRT1O95170 752 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CKMP06732 381 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 KLK1P06870 262 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PNLIPRP1P54315 467 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 EPHB3P54753 998 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SCN1BQ07699 218 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ASAH1Q13510 395 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 REEP3Q6NUK4 255 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PROKR2Q8NFJ6 384 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TSSK6Q9BXA6 273 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TMCC3Q9ULS5 477 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.21□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PIPSLA2A3N6 862 aa14.2□□□□□ -0.14
SYP-201ENST00000263233 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.2□□□□□ -0.14
SYP-201ENST00000263233 H3BN98 237 aa14.2□□□□□ -0.14
SYP-201ENST00000263233 NPPBP16860 134 aa14.2□□□□□ -0.14
SYP-201ENST00000263233 ZNF30P17039 623 aa14.2□□□□□ -0.14
SYP-201ENST00000263233 DCDC1P59894 354 aa14.2□□□□□ -0.14
SYP-201ENST00000263233 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
SYP-201ENST00000263233 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
SYP-201ENST00000263233 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
SYP-201ENST00000263233 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.2□□□□□ -0.14
SYP-201ENST00000263233 TRAM1L1Q8N609 369 aa14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms