RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 SUN5Q8TC36 379 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 NRTNQ99748 197 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALG5Q9Y673 324 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ETV5P41161 510 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ETV1P50549 477 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPNMBQ14956 572 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHST9Q7L1S5 443 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 PDZD3Q86UT5 571 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 VWA5B2Q8N398 1253 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALG14Q96F25 216 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 NTN1O95631 604 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC16A8O95907 504 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR56A5P0C7T3 313 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 KRT73Q86Y46 540 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM46DQ8NEK8 389 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 DEDD2Q8WXF8 326 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 REPS1Q96D71 796 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 STUB1Q9UNE7 303 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SSR3Q9UNL2 185 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD70P32970 193 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TEAD4Q15561 434 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SETD6Q8TBK2 473 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 GATAD2BQ8WXI9 593 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 GALNT9Q9HCQ5 603 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAT2BQ9NZL9 334 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A1B0GVC2 190 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 A6NIN4 97 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 FADS2P1A8MWK0 482 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 UQCRC1P31930 480 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 AP1S1P61966 158 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TXNDC8Q6A555 127 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 AGTRAPQ6RW13 159 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CREB3L4Q8TEY5 395 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 KLHL6Q8WZ60 621 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 NEIL2Q969S2 332 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM80Q96HE8 168 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 FCRL1Q96LA6 429 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 NELL2Q99435 816 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 HDHD5Q9BXW7 423 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR52Q9Y2T5 361 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 HSPB11Q9Y547 144 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRKYO43930 277 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 C2orf80Q0P641 193 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 QPRTQ15274 297 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF740Q8NDX6 193 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR52P1PQ8NH57 321 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAP6Q96JE9 813 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLA2Q9H6Q3 261 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC25A19Q9HC21 320 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 DKK3Q9UBP4 350 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TEKT2Q9UIF3 430 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 BTNL2Q9UIR0 455 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ENPP4Q9Y6X5 453 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC35F4A4IF30 521 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYL12BO14950 172 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SOX18P35713 384 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTPN5P54829 565 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TAS2R50P59544 299 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAPQ12884 760 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR33Q49SQ1 333 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SIGIRRQ6IA17 410 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMC8Q8IU68 726 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR4D11Q8NGI4 311 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPNS1Q9H2V7 528 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 MCUBQ9NWR8 336 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 REV1Q9UBZ9 1251 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 HYKKA2RU49 373 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 DVL2O14641 736 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARHGEF15O94989 841 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 BCHEP06276 602 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 C8GP07360 202 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTNP21246 168 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 PDHA2P29803 388 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms