RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 ARMCX1Q9P291 453 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CAPN14A8MX76 684 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 PCSK2P16519 638 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CALB2P22676 271 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 UCNP55089 124 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 RPS18P62269 152 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 PTGR1Q14914 329 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 ST3GAL2Q16842 350 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 SYT16Q17RD7 645 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC81Q6ZN84 652 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 STARD8Q92502 1023 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 SLC45A3Q96JT2 553 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 EGLN2Q96KS0 407 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 TSSK3Q96PN8 268 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF385DQ9H6B1 395 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CTSFQ9UBX1 484 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 PHF11Q9UIL8 331 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 FBXW2Q9UKT8 454 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CAPN7Q9Y6W3 813 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CHST10O43529 356 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 ASMTP46597 345 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 ATP4BP51164 291 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 TAS2R50P59544 299 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 IKBIPQ70UQ0 350 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 GPR180Q86V85 440 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 FAM9CQ8IZT9 166 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 MIEF2Q96C03 454 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 SLC26A1Q9H2B4 701 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 MS4A12Q9NXJ0 267 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 TCFL5Q9UL49 500 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 ATG4BQ9Y4P1 393 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD28O15084 1053 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 PROM1O43490 865 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 GUCY1B2O75343 617 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 IL3P08700 152 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 PRDX6P30041 224 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 FOLR3P41439 243 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CLDN8P56748 225 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 TMPRSS3P57727 454 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 RAB38P57729 211 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 NKG7Q16617 165 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 SPRED3Q2MJR0 410 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 FAM71E1Q6IPT2 247 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 SHISA5Q8N114 240 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 EFCAB3Q8N7B9 438 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 OR51Q1Q8NH59 317 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CLHC1Q8NHS4 586 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 STT3BQ8TCJ2 826 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 WDR54Q9H977 334 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 ARL8BQ9NVJ2 186 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 C14orf105Q9NVL8 296 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 TAGLN3Q9UI15 199 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 SSUH2Q9Y2M2 353 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1W2PR48 441 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 EFSO43281 561 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CREG1O75629 220 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CBX6O95503 412 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 RNH1P13489 461 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 WT1P19544 449 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CPN2P22792 545 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 XCR1P46094 333 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 MNAT1P51948 309 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 STX1BP61266 288 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 MC1RQ01726 317 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 TNFRSF17Q02223 184 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 KLC1Q07866 573 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 SQLEQ14534 574 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 RPS6KA2Q15349 733 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 VWA2Q5GFL6 755 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 PRSS58Q8IYP2 241 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CDC26Q8NHZ8 85 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 CMTM5Q96DZ9 223 aa18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms