RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 TMIEQ8NEW7 156 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 SLC38A5Q8WUX1 472 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 OR5P2Q8WZ92 322 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 CENPOQ9BU64 300 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 ACAT2Q9BWD1 397 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 INIPQ9NRY2 104 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 TMCC3Q9ULS5 477 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 SLC6A14Q9UN76 642 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 PLPP1O14494 284 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 ZW10O43264 779 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 AQP9O43315 295 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 MMP20O60882 483 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 SEMA3DO95025 777 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 RECKO95980 971 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 CYP17A1P05093 508 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 DDX5P17844 614 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 FUT4P22083 530 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 CNR2P34972 360 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 PRKCDQ05655 676 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 CD300CQ08708 224 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 HEPACAMQ14CZ8 416 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 DEPDC1Q5TB30 811 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 SAXO2Q658L1 398 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 PNCKQ6P2M8 343 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 C7orf61Q8IZ16 206 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 OR8D1Q8WZ84 308 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 ARRDC3Q96B67 414 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 MGLLQ99685 303 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 OR52A5Q9H2C5 316 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 NEUROD4Q9HD90 331 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 A4GALTQ9NPC4 353 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 TBX1O43435 398 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 PDE9AO76083 593 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 ADAP00813 363 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 BCHEP06276 602 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 ADRB3P13945 408 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 CXCR2P25025 360 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 POU1F1P28069 291 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 SOX6P35712 828 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 LIM2P55344 173 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 DSG4Q86SJ6 1040 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 C17orf64Q86WR6 236 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 HORMAD2Q8N7B1 307 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 OR5AR1Q8NGP9 310 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 BADQ92934 168 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 RHBGQ9H310 441 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 DSPPQ9NZW4 1301 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 FFAR1O14842 300 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 SH3BP5O60239 455 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 TBX19O60806 448 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 MED26O95402 600 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 ALDH9A1P49189 494 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 TMED10P49755 219 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 UGT2B15P54855 530 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 SLC13A2Q13183 592 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 PLAG1Q6DJT9 500 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 C11orf96Q7Z7L8 435 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 PDZD3Q86UT5 571 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 C12orf40Q86WS4 652 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 ING5Q8WYH8 240 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 HPS1Q92902 700 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 AIF1LQ9BQI0 150 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 RNF167Q9H6Y7 350 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 CCRL2O00421 344 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 PDPK1O15530 556 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 ADH1CP00326 375 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 PIPP12273 146 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 MAGEA8P43361 318 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 CRISP3P54108 245 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 RPS26P62854 115 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 CNTN1Q12860 1018 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 RPA4Q13156 261 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 C9orf64Q5T6V5 341 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 STEAP3Q658P3 488 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 NLGN4XQ8N0W4 816 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 PARP16Q8N5Y8 322 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 TM4SF18Q96CE8 201 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 TMEM19Q96HH6 336 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 OR5M11Q96RB7 305 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms