RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217515.10

TXNL1-201, Transcript of thioredoxin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TXNL1, Length 6,894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1-201ENST00000217515 MAGEA2P43356 314 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 TDHQ8IZJ6 230 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 PQLC1Q8N2U9 271 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 LINC00471Q8N535 108 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 OR56A3Q8NH54 315 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 SLC35F5Q8WV83 523 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 FGF13Q92913 245 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 OR51I1Q9H343 314 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 TRIM36Q9NQ86 728 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 LRIT1Q9P2V4 623 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 PLIN4Q96Q06 1357 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 TRIM64CA6NLI5 447 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 RAP2AP10114 183 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 ANXA8P13928 327 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 PORP16435 677 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 GSTM4Q03013 218 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 RUNX2Q13950 521 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 DCAF12L1Q5VU92 463 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 FIGNL1Q6PIW4 674 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 HACD2Q6Y1H2 254 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 PAQR7Q86WK9 346 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 LRTOMTQ8WZ04 291 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 OSTF1Q92882 214 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 ECHDC3Q96DC8 303 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 CXorf56Q9H5V9 222 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 MAGEE1Q9HCI5 957 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 GPRC5BQ9NZH0 403 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 CD53P19397 219 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 UQCRC2P22695 453 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 SOX9P48436 509 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 TBPL1P62380 186 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 PTP4A2Q12974 167 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 TRIM61Q5EBN2 209 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 PPP1R3BQ86XI6 285 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 RASGEF1CQ8N431 466 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 CEP76Q8TAP6 659 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 LINC00597Q9H2U6 94 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 STARD5Q9NSY2 213 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 SLC35F4A4IF30 521 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 PIGRP01833 764 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 EBLN1P0CF75 366 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 VAMP1P23763 118 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 SLC9A3P48764 834 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 GPR143P51810 404 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 TDGQ13569 410 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 LRFN4Q6PJG9 635 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 HTRA1Q92743 480 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 ZNF442Q9H7R0 627 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 ZNF175Q9Y473 711 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 SOCS2O14508 198 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 OR4C11Q6IEV9 310 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 MARCH9Q86YJ5 346 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 PRR18Q8N4B5 295 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 OR4K1Q8NGD4 311 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 TNFRSF25Q93038 417 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 REEP4Q9H6H4 257 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 GSKIPQ9P0R6 139 aa10.63□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 YY2O15391 372 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 PRKCAP17252 672 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 CD70P32970 193 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 GRIN2CQ14957 1233 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 HMGN2P46Q86SG4 172 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 GAREM1Q9H706 876 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 SAGE1Q9NXZ1 904 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 RHCGQ9UBD6 479 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 EPHA6Q9UF33 1036 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 ABCC6O95255 1503 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 PIRO00625 290 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 FBP2O00757 339 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 EDF1O60869 148 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 SUOXP51687 545 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 PSPHP78330 225 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 XIAPP98170 497 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 NFE2L1Q14494 772 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 DOHHQ9BU89 302 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 DERL2Q9GZP9 239 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 ZNF69Q9UC07 566 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 C10orf71Q711Q0 1435 aa10.62□□□□□ -0.71
TXNL1-201ENST00000217515 C1orf226A1L170 272 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms