RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637548.1

ARID1B-226, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

Gene ARID1B, Length 2,255 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-226	ENST00000637548	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-226	ENST00000637548	INIP	Q9NRY2	104 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-226	ENST00000637548	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-226	ENST00000637548	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-226	ENST00000637548	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-226	ENST00000637548	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-226	ENST00000637548	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-226	ENST00000637548	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GSAP	A4D1B5	854 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	IQCF5	A8MTL0	148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548		F8WDY8	70 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	DHH	O43323	396 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LAT	O43561	262 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	RHBDL1	O75783	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	AREG	P15514	252 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GM2A	P17900	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ITGB6	P18564	788 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	AOC1	P19801	751 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MMP12	P39900	470 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MAGEA3	P43357	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CSNK1D	P48730	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	NAGLU	P54802	743 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ADPRH	P54922	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	NRG3	P56975	720 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PEX6	Q13608	980 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CHRNA6	Q15825	494 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CDKN3	Q16667	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MCU	Q8NE86	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	NDN	Q99608	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	KCNK13	Q9HB14	408 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	IL26	Q9NPH9	171 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548		X6R8D5	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MYLK	Q15746	1914 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548		E9PI62	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ALOX15B	O15296	676 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CTAG2	O75638	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF205	O95201	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CER1	O95813	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	OTC	P00480	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CD1A	P06126	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	DDC	P20711	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CA4	P22748	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ADRA1D	P25100	572 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CD6	P30203	668 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	VIPR1	P32241	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MAGEA6	P43360	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PER3	P56645	1201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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