RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626874.2

CHD2-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CHD2, Length 7,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD2-208	ENST00000626874	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874		M0R036	132 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SEMA4F	O95754	770 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TYRP1	P17643	537 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	THBS3	P49746	956 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	MPP1	Q00013	466 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CDK6	Q00534	326 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	RING1	Q06587	406 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	PERM1	Q5SV97	790 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	RDH10	Q8IZV5	341 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	PRELID2	Q8N945	189 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	FAM110B	Q8TC76	370 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	RNF128	Q8TEB7	428 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	APOL3	O95236	402 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	WDPCP	O95876	746 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ADH6	P28332	368 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	GSTT1	P30711	240 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	NIPAL3	Q6P499	406 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874		Q6ZVU0	165 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SCLY	Q96I15	445 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CCDC32	Q9BV29	185 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CA14	Q9ULX7	337 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	LRRTM2	O43300	516 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ART1	P52961	327 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	GPX6	P59796	221 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SHF	Q7M4L6	423 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ANKRD46	Q86W74	232 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	COQ8A	Q8NI60	647 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	THAP4	Q8WY91	577 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF69	Q9UC07	566 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TFR2	Q9UP52	801 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TIMM22	Q9Y584	194 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	MEGF11	A6BM72	1044 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	FAM170B	A6NMN3	283 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TPST2	O60704	377 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SLC19A2	O60779	497 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CXCL12	P48061	93 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	DSC1	Q08554	894 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	RPA4	Q13156	261 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	LRP8	Q14114	963 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	GK5	Q6ZS86	529 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	NXPE3	Q969Y0	559 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	FAM84A	Q96KN4	292 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TGM7	Q96PF1	710 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	DERL2	Q9GZP9	239 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	NUP50	Q9UKX7	468 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	FLRT2	O43155	660 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	BCHE	P06276	602 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	MPST	P25325	297 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	CHRNA6	Q15825	494 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	CORO2A	Q92828	525 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	LRRC58	Q96CX6	371 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		6.65	□□□□□ -1.35

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