RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACVR2A	P27037	513 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CD40LG	P29965	261 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCR1	P32246	355 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RYK	P34925	604 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ADRA1A	P35348	466 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GRIA1	P42261	906 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RFX2	P48378	723 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RGS7	P49802	495 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BCAP31	P51572	246 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RAD23A	P54725	363 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCNK10	P57789	538 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DAOA	P59103	153 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDKL1	Q00532	357 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SP4	Q02446	784 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RELA	Q04206	551 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EMX2	Q04743	252 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACVR1	Q04771	509 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF33B	Q06732	778 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DMWD	Q09019	674 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LCP2	Q13094	533 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRKG2	Q13237	762 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GK3P	Q14409	553 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EID3	Q8N140	333 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C12orf29	Q8N999	325 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GIPC3	Q8TF64	312 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC58	Q96CX6	371 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C19orf60	Q96EN9	201 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF599	Q96NL3	588 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIB3	Q96RU7	358 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MRO	Q9BYG7	248 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DERL2	Q9GZP9	239 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EHD1	Q9H4M9	534 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POMK	Q9H5K3	350 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SP140L	Q9H930	580 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SIAE	Q9HAT2	523 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C3orf18	Q9UK00	162 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525		Q9Y3F1	56 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525		A0A0J9YYE9	177 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525		A0A1B0GVG6	124 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.39	□□□□□ -1.71

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