RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598346.5

FARP1-223, Transcript of FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1, human

TSL 5

Gene FARP1, Length 756 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FARP1-223	ENST00000598346	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346		A0A087X0K7	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	MLNR	O43193	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	KRT86	O43790	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	IGHE	P01854	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	VCL	P18206	1134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	GRB14	Q14449	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	KRT81	Q14533	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	TEX26	Q8N6G2	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	CASP10	Q92851	521 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	WBP2	Q969T9	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	OMA1	Q96E52	524 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	IL12RB2	Q99665	862 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	SPG21	Q9NZD8	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346	PCNT	O95613	3336 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FARP1-223	ENST00000598346		A0A1W2PRV1	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	FAM149A	A5PLN7	773 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	ZNF732	B4DXR9	585 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	MAGEB2	O15479	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CEACAM4	O75871	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	ATP6V1B1	P15313	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CTNNB1	P35222	781 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	NME5	P56597	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	IRX4	P78413	519 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	DRP2	Q13474	957 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	COG3	Q96JB2	828 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	NEDD4	P46934	1319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	ADCY9	O60503	1353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SURF4	O15260	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	RTN2	O75298	545 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	GRAP2	O75791	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	TYMP	P19971	482 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CASP3	P42574	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	PMP22	Q01453	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	ACKR1	Q16570	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CES4A	Q5XG92	561 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	ASPG	Q86U10	573 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	ZNF614	Q8N883	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	STX8	Q9UNK0	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	LRRC37A3	O60309	1634 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	RTL1	A6NKG5	1358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	USP6	P35125	1406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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