RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592385.5

HDAC5-211, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC5, Length 2,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-211ENST00000592385 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 HSD17B2P37059 387 aa14.56□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 OR5AR1Q8NGP9 310 aa14.56□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ITFG2Q969R8 447 aa14.56□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 C5orf58C9J3I9 102 aa14.55□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 MAPK12P53778 367 aa14.55□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.55□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.55□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa14.55□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.55□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 AMZ2Q86W34 360 aa14.55□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.55□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 PTHP01270 115 aa14.54□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 RPN2P04844 631 aa14.54□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 POU2F1P14859 743 aa14.54□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 CHMP24386 653 aa14.54□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 GSTM5P46439 218 aa14.54□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 RGS6P49758 472 aa14.54□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 MESP2Q0VG99 397 aa14.54□□□□□ -0.08
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