RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592275.5

USP36-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 4

Gene USP36, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-222	ENST00000592275	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	ACAN	P16112	2415 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	DOCK7	Q96N67	2140 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275		A0A0G2JNJ9	132 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	ACOT7	O00154	380 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	WWP2	O00308	870 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	CES2	O00748	559 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	CLDN4	O14493	209 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	AQP7	O14520	342 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	BCKDK	O14874	412 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	B3GALT2	O43825	422 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	CTNS	O60931	367 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	CELA3A	P09093	270 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	EPOR	P19235	508 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	SAT1	P21673	171 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	GGT5	P36269	586 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	ADH7	P40394	386 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	MAGEA5	P43359	124 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	PLA2G16	P53816	162 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	MTTP	P55157	894 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	MORF4L2	Q15014	288 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	LYPD8	Q6UX82	237 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	HSDL2	Q6YN16	418 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	RTL4	Q6ZR62	310 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	GK5	Q6ZS86	529 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	SLC35F6	Q8N357	371 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	MORN4	Q8NDC4	146 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	LRRC39	Q96DD0	335 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	FAR2	Q96K12	515 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	EGFL8	Q99944	293 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275		Q9UFV3	132 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-222	ENST00000592275	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	ABCA4	P78363	2273 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	SCEL	O95171	688 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	CCL3	P10147	92 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	CNR1	P21554	472 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	IST1	P53990	364 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	RNF4	P78317	190 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	PLGLB1	Q02325	96 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	TGFBI	Q15582	683 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	PAOX	Q6QHF9	649 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	ZNF721	Q8TF20	911 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	DERL2	Q9GZP9	239 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	LYRM4	Q9HD34	91 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	ZNF358	Q9NW07	568 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	SNX12	Q9UMY4	172 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275		A0A088AWK7	358 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	FAM221A	A4D161	298 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275		E7ESA3	106 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	CTAG2	O75638	210 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	ETHE1	O95571	254 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	IGKV3-11	P04433	115 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	DNASE1L1	P49184	302 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	MGAT5	Q09328	741 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	CBLB	Q13191	982 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	BMPR2	Q13873	1038 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	PDIK1L	Q8N165	341 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	KRT78	Q8N1N4	520 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	CCT6B	Q92526	530 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	NINJ1	Q92982	152 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	VPS39	Q96JC1	886 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-222	ENST00000592275	SGCZ	Q96LD1	299 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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