RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 LIPGQ9Y5X9 500 aa11.24□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 ZFHX3Q15911 3703 aa11.24□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 A8MVJ9 347 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
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CTIF-208ENST00000590422 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa11.23□□□□□ -0.61
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CTIF-208ENST00000590422 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 ZNF595Q8IYB9 648 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 EID3Q8N140 333 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 KRT78Q8N1N4 520 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 OR2M7Q8NG81 312 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 ASB15Q8WXK1 588 aa11.23□□□□□ -0.61
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CTIF-208ENST00000590422 SERINC2Q96SA4 455 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 CCDC77Q9BR77 488 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 TTTY12Q9BZ98 90 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 DERL2Q9GZP9 239 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 HPF1Q9NWY4 346 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 WWOXQ9NZC7 414 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 GPRC5BQ9NZH0 403 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 SNX24Q9Y343 169 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 NPIPA2E9PIF3 369 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 NPIPA3F8WFD2 350 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 CLDN4O14493 209 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 LDB3O75112 727 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 TOXO94900 526 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 GLSO94925 669 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 IFNA16P05015 189 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 CELA3AP09093 270 aa11.22□□□□□ -0.61
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CTIF-208ENST00000590422 NUP107P57740 925 aa11.22□□□□□ -0.61
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CTIF-208ENST00000590422 DOC2AQ14183 400 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 TRADDQ15628 312 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 ZNF750Q32MQ0 723 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 HSDL2Q6YN16 418 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 ZBED8Q8IZ13 594 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 SNX31Q8N9S9 440 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 OR5M9Q8NGP3 310 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 RND1Q92730 232 aa11.22□□□□□ -0.61
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CTIF-208ENST00000590422 OR8D2Q9GZM6 311 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 DPH5Q9H2P9 285 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 EHD1Q9H4M9 534 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 NT5DC2Q9H857 520 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 POPDC3Q9HBV1 291 aa11.22□□□□□ -0.61
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CTIF-208ENST00000590422 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.22□□□□□ -0.61
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CTIF-208ENST00000590422 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 A0A088AWK7 358 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 ESYT3A0FGR9 886 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 ANKDD1BA6NHY2 528 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 RTCAO00442 366 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 CTNSO60931 367 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 SH3BGRLO75368 114 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 ETHE1O95571 254 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 CCDC166P0CW27 439 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 CD1DP15813 335 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 CAPN3P20807 821 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 MSX1P28360 303 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 SSTR1P30872 391 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 POU4F1Q01851 419 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 PLGLB1Q02325 96 aa11.21□□□□□ -0.61
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