RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	MAOB	P27338	520 aa		14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	TPTE	P56180	551 aa		14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CYP4F2	P78329	520 aa		14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	HKDC1	Q2TB90	917 aa		14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PGS1	Q32NB8	556 aa		14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SMUG1	Q53HV7	270 aa		14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PLPP1	O14494	284 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	YY2	O15391	372 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	OR1F1	O43749	312 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	BCKDHB	P21953	392 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CD38	P28907	300 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	KIR3DL1	P43629	444 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ASMT	P46597	345 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	MTPN	P58546	118 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	GABARAPL2	P60520	117 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ABAT	P80404	500 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	LIPE	Q05469	1076 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	GPR18	Q14330	331 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	GTDC1	Q4AE62	458 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF425	Q6IV72	752 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ANKRD46	Q86W74	232 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	NAGS	Q8N159	534 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	MED30	Q96HR3	178 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	INPP5K	Q9BT40	448 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	LRRC61	Q9BV99	259 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	AICDA	Q9GZX7	198 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	KCNH6	Q9H252	994 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ALG2	Q9H553	416 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	FANCE	Q9HB96	536 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	USP22	Q9UPT9	525 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	TRBC2	A0A5B9	178 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	GABRR3	A8MPY1	467 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	NOTO	A8MTQ0	251 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	HAT1	O14929	419 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ACOX3	O15254	700 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ASNA1	O43681	348 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SEMA3D	O95025	777 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	UMPS	P11172	480 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	LAMP1	P11279	417 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	GRK3	P35626	688 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	BCL6	P41182	706 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CDKN2C	P42773	168 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CXCL12	P48061	93 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	DMWD	Q09019	674 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	C1orf61	Q13536	156 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	FXN	Q16595	210 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	LCN8	Q6JVE9	175 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ADCK2	Q7Z695	626 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	C11orf74	Q86VG3	221 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	F2RL3	Q96RI0	385 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	DPH7	Q9BTV6	452 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SARG	Q9BW04	601 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	LHX9	Q9NQ69	397 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	POT1	Q9NUX5	634 aa		14.66	□□□□□ -0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms