RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
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CAPNS1-205ENST00000588780 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-205ENST00000588780 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-205ENST00000588780 DUPD1Q68J44 220 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-205ENST00000588780 C4orf22Q6V702 233 aa20.09■□□□□ 0.81
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CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF592Q92610 1267 aa20.09■□□□□ 0.81
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CAPNS1-205ENST00000588780 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa20.09■□□□□ 0.81
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CAPNS1-205ENST00000588780 TGFBR3LH3BV60 316 aa20.08■□□□□ 0.81
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CAPNS1-205ENST00000588780 SLC22A10Q63ZE4 541 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-205ENST00000588780 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-205ENST00000588780 LACC1Q8IV20 430 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-205ENST00000588780 ANKRD53Q8N9V6 530 aa20.08■□□□□ 0.81
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CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa20.08■□□□□ 0.81
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CAPNS1-205ENST00000588780 HRGP04196 525 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 RFPL3SP0C7P2 107 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 SMIM10L1P0DMW3 83 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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CAPNS1-205ENST00000588780 RNF4P78317 190 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 CDK16Q00536 496 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 REEP5Q00765 189 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 STX4Q12846 297 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 RUNX2Q13950 521 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 PRAMEF20Q5VT98 475 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 CTAGE6Q86UF2 777 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 MORN4Q8NDC4 146 aa20.07■□□□□ 0.8
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CAPNS1-205ENST00000588780 OR56A3Q8NH54 315 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 LINGO1Q96FE5 620 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 SMIM10Q96HG1 83 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 NDNQ99608 321 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 ZFP64Q9NPA5 681 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 ARID1AO14497 2285 aa20.07■□□□□ 0.8
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CAPNS1-205ENST00000588780 C4orf51C9J302 202 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 B3GALT2O43825 422 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 HAUS5O94927 633 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 SERPINA6P08185 405 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 TIMP3P35625 211 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF136P52737 540 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 SORDQ00796 357 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 BBS9Q3SYG4 887 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF595Q8IYB9 648 aa20.06■□□□□ 0.8
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CAPNS1-205ENST00000588780 GPATCH11Q8N954 259 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 RNF214Q8ND24 703 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 OR14A16Q8NHC5 309 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 ATL1Q8WXF7 558 aa20.06■□□□□ 0.8
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CAPNS1-205ENST00000588780 COPS7AQ9UBW8 275 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.06■□□□□ 0.8
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CAPNS1-205ENST00000588780 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 CALML6Q8TD86 181 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 PIGTQ969N2 578 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 GAL3ST3Q96A11 431 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIB1Q96RU8 372 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 PELI2Q9HAT8 420 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 TAS2R13Q9NYV9 303 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.05■□□□□ 0.8
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