RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588516.5

NEDD4L-223, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 1,304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-223	ENST00000588516	SIAE	Q9HAT2	523 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	RASSF1	Q9NS23	344 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	MYO10	Q9HD67	2058 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCDHGA12	O60330	932 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	RFPL2	O75678	378 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DIRAS1	O95057	198 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	GADD45G	O95257	159 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	C6orf47	O95873	294 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CD6	P30203	668 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	MASP1	P48740	699 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDH12	P55289	794 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	HBA1	P69905	142 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DGCR6	Q14129	220 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	GNA13	Q14344	377 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	STARD3	Q14849	445 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TAGAP	Q8N103	731 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TAMM41	Q96BW9	452 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF607	Q96SK3	696 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	RHBG	Q9H310	441 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SELENON	Q9NZV5	590 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CCL26	Q9Y258	94 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	YY2	O15391	372 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ETHE1	O95571	254 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADA	P00813	363 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	RHO	P08100	348 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADH5	P11766	374 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ETFA	P13804	333 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	XCR1	P46094	333 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TAS2R50	P59544	299 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	VBP1	P61758	197 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TAP2	Q03519	686 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	UBE3A	Q05086	875 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDC20	Q12834	499 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	GAB1	Q13480	694 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ANGPT1	Q15389	498 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DUSP6	Q16828	381 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAM124A	Q86V42	546 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	KRT73	Q86Y46	540 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	RNF175	Q8N4F7	328 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC5A8	Q8N695	610 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	NFKBID	Q8NI38	313 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	NDNF	Q8TB73	568 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	NR4A3	Q92570	626 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PROX1	Q92786	737 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	KCNC2	Q96PR1	638 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	S1PR5	Q9H228	398 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DMD	P11532	3685 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	IRGM	A1A4Y4	181 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-223	ENST00000588516	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-223	ENST00000588516	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-223	ENST00000588516	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-223	ENST00000588516	SH3BP5	O60239	455 aa		13.39	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms