RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587928.5

ILF3-208, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 4,230 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-208	ENST00000587928	SYTL3	Q4VX76	610 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ZFP90	Q8TF47	636 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	FOPNL	Q96NB1	174 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	KCNH6	Q9H252	994 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	DSN1	Q9H410	356 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CD93	Q9NPY3	652 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	GNGT2	O14610	69 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	GRM6	O15303	877 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CDK1	P06493	297 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	C8A	P07357	584 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	RAP2A	P10114	183 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	NCK1	P16333	377 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	RORA	P35398	523 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	SPAM1	P38567	509 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF77	Q15935	545 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	UGT8	Q16880	541 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	TACR1	P25103	407 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	TGFBR2	P37173	567 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	OPRD1	P41143	372 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ABAT	P80404	500 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	MAB21L1	Q13394	359 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	PTGR1	Q14914	329 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF284	Q2VY69	593 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF404	Q494X3	552 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ESAM	Q96AP7	390 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	COPS8	Q99627	209 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CIPC	Q9C0C6	399 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	SLC22A4	Q9H015	551 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	DUSP21	Q9H596	190 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ACTR8	Q9H981	624 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	MALT1	Q9UDY8	824 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CLDN7	O95471	211 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ANXA5	P08758	320 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	BCKDHA	P12694	445 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	SLC2A4	P14672	509 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	PCSK2	P16519	638 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CPZ	Q66K79	652 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928		H0YIV9	168 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF197	O14709	1029 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	RGS14	O43566	566 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	KCNK5	O95279	499 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	MAG	P20916	626 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ATP6V1E1	P36543	226 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	GPLD1	P80108	840 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	SCN1B	Q07699	218 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	OR56A3	Q8NH54	315 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	FBXO30	Q8TB52	745 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CCDC32	Q9BV29	185 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	TMEM131	Q92545	1883 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	FAM149A	A5PLN7	773 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	WNT9A	O14904	365 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	SGCE	O43556	437 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	PDYN	P01213	254 aa		10.44	□□□□□ -0.74

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