RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	DCDC1	P59894	354 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	UFM1	P61960	85 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	APOF	Q13790	326 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	GK3P	Q14409	553 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC36A3	Q495N2	470 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SBSN	Q6UWP8	590 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289		Q6ZSR9	355 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SFRP1	Q8N474	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	NATD1	Q8N6N6	113 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2T12	Q8NG77	320 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TESC	Q96BS2	214 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	REPS1	Q96D71	796 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	B3GALT6	Q96L58	329 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ACOX2	Q99424	681 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CGREF1	Q99674	301 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CIB1	Q99828	191 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CHID1	Q9BWS9	393 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ACTR8	Q9H981	624 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	HPS4	Q9NQG7	708 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	OLAH	Q9NV23	265 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CMTM6	Q9NX76	183 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	BTRC	Q9Y297	605 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CPQ	Q9Y646	472 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289		G3V2T6	193 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	GFY	I3L273	518 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	FXYD1	O00168	92 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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