RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CCL21	O00585	134 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	KLK8	O60259	260 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	NME2P1	O60361	137 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ZG16	O60844	167 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	LDB3	O75112	727 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ITGA10	O75578	1167 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC25A12	O75746	678 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	KRT38	O76015	456 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	WISP2	O76076	250 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	RBP1	P09455	135 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	NME2	P22392	152 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CPN2	P22792	545 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SSR2	P43308	183 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SERPINB9	P50453	376 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	RAP1GDS1	P52306	607 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CASP6	P55212	293 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PHEX	P78562	749 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SLAMF1	Q13291	335 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	GTF2H2	Q13888	395 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	MORN4	Q8NDC4	146 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	REPS1	Q96D71	796 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR137	Q96N19	417 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	FRMD6	Q96NE9	622 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR78	Q96P69	363 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CENPK	Q9BS16	269 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	IPPK	Q9H8X2	491 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		8.76	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479		H0YIV9	168 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ASNA1	O43681	348 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	UGDH	O60701	494 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC19A2	O60779	497 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SCEL	O95171	688 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CLDN9	O95484	217 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	COL6A2	P12110	1019 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CNTF	P26441	200 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	DCT	P40126	519 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CA7	P43166	264 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PIK3CG	P48736	1102 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SSR4	P51571	173 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ARFIP1	P53367	373 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	BIK	Q13323	160 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	LGSN	Q5TDP6	509 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF787	Q6DD87	383 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	MTFR2	Q6P444	385 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	HSDL2	Q6YN16	418 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR180	Q86V85	440 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SULF2	Q8IWU5	870 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF175	Q8N4F7	328 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	TANK	Q92844	425 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PHF21B	Q96EK2	531 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SCYL1	Q96KG9	808 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PAFAH2	Q99487	392 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF358	Q9NW07	568 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		8.75	□□□□□ -1.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms