RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565987.5

NUBP2-208, Transcript of nucleotide binding protein 2, human

TSL 5 BASIC

Gene NUBP2, Length 1,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUBP2-208	ENST00000565987	COX6B1	P14854	86 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	NME2	P22392	152 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	CYB561	P49447	251 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	HLCS	P50747	726 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	GPR143	P51810	404 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	RBPJ	Q06330	500 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	TGM3	Q08188	693 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	MED27	Q6P2C8	311 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	LAS2	Q8IYD9	372 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	TEX9	Q8N6V9	391 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	OR7G3	Q8NG95	312 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	UBE2E3	Q969T4	207 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	VMP1	Q96GC9	406 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	GPR137	Q96N19	417 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	KCNC2	Q96PR1	638 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	CHST11	Q9NPF2	352 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987		A0A096LPK6	155 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	SYCE1L	A8MT33	242 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	CCL21	O00585	134 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	CDK2AP1	O14519	115 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	FCHO1	O14526	889 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	SLC19A2	O60779	497 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	CTNS	O60931	367 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	EPB42	P16452	691 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	PHB	P35232	272 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	CA7	P43166	264 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	PCDH1	Q08174	1060 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	SETDB1	Q15047	1291 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	PFKFB4	Q16877	469 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	SIAH3	Q8IW03	269 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ZNF592	Q92610	1267 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	CCDC120	Q96HB5	630 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	OR51B5	Q9H339	312 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	LYRM4	Q9HD34	91 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ZNHIT1	O43257	154 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	LDB3	O75112	727 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ITGA10	O75578	1167 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	KLHL2	O95198	593 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	IFNA16	P05015	189 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	GFAP	P14136	432 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	TYK2	P29597	1187 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	SSR2	P43308	183 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	SERPINB8	P50452	374 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	KRTAP10-9	P60411	292 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ID2	Q02363	134 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	RCN2	Q14257	317 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ACAP2	Q15057	778 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	C3AR1	Q16581	482 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	GPR78	Q96P69	363 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	CCDC77	Q9BR77	488 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	VPS11	Q9H270	941 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
NUBP2-208	ENST00000565987	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		14.67	□□□□□ -0.06

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