RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	NCLN	Q969V3	563 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	VMP1	Q96GC9	406 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	IPPK	Q9H8X2	491 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTR8	Q9H981	624 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	NFU1	Q9UMS0	254 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200		A1L4Q6	167 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	RBP1	P09455	135 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	COL6A2	P12110	1019 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CNTF	P26441	200 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CYB561	P49447	251 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	HLCS	P50747	726 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	ARFIP1	P53367	373 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP112	Q8N8E3	955 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	FRMD6	Q96NE9	622 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	XPR1	Q9UBH6	696 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	PLPP1	O14494	284 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	OR7A17	O14581	309 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	NME2P1	O60361	137 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	LDB3	O75112	727 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A12	O75746	678 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	UNC5C	O95185	931 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD2	P08910	425 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	NME2	P22392	152 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	SSR2	P43308	183 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	PIK3CG	P48736	1102 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	RELT	Q969Z4	430 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	RGMA	Q96B86	450 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		20.27	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		20.27	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	STX16	O14662	325 aa		20.27	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	GCA	P28676	217 aa		20.27	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	20.27	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	STX4	Q12846	297 aa		20.27	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	20.27	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		20.27	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		20.27	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	REPS1	Q96D71	796 aa		20.27	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	20.27	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	TMCO1	Q9UM00	188 aa		20.27	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		20.27	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GUH1	482 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	FCHO1	O14526	889 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	ETHE1	O95571	254 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	SBK3	P0C264	359 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	GTF3C1	Q12789	2109 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	SLAMF1	Q13291	335 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	CUL3	Q13618	768 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	SERTAD2	Q14140	314 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	SIAH3	Q8IW03	269 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	MORN4	Q8NDC4	146 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	PHF21B	Q96EK2	531 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	NTMT1	Q9BV86	223 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		20.27	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	PCTP	Q9UKL6	214 aa		20.27	■□□□□ 0.83

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