RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557673.5

NEK9-211, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 3

Gene NEK9, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-211ENST00000557673 ADNP2Q6IQ32 1131 aa15.62■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 TMEM205Q6UW68 189 aa15.62■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 TLCD1Q96CP7 247 aa15.62■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 ACTR8Q9H981 624 aa15.62■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 OXSMQ9NWU1 459 aa15.62■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 MKL2Q9ULH7 1088 aa15.62■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa15.62■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 PKDREJQ9NTG1 2253 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 H0YIG0 161 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 SGK494L7N484 410 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 SLC19A2O60779 497 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 SUPT7LO94864 414 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 CYC1P08574 325 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 C8orf89P0DMQ9 161 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 SSTR2P30874 369 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 HNF4AP41235 474 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 ETV4P43268 484 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 CCNG1P51959 295 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 CLCQ05315 142 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 PWP1Q13610 501 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 PCOLCEQ15113 449 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 GGTA1PQ4G0N0 100 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 KRTCAP3Q53RY4 240 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 LIPMQ5VYY2 423 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 VN1R5Q7Z5H4 357 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 PDSS2Q86YH6 399 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 L3MBTL4Q8NA19 623 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 TTLQ8NG68 377 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 NT5CQ8TCD5 201 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 MAGED4Q96JG8 741 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 ZNF382Q96SR6 550 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 SH3GL2Q99962 352 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 NTMT1Q9BV86 223 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 GSTO2Q9H4Y5 243 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 ANKHQ9HCJ1 492 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 A0A1B0GTL3 188 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 ZNF860A6NHJ4 632 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 TM9SF1O15321 606 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 RDH16O75452 317 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 SASH3O75995 380 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 OTCP00480 354 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 SERPIND1P05546 499 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 TSPAN8P19075 237 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 XCR1P46094 333 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 CDH13P55290 713 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 RGS1Q08116 209 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 LCP2Q13094 533 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 ZNF766Q5HY98 468 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 AGBL2Q5U5Z8 902 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 LIPJQ5W064 366 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 LETMD1Q6P1Q0 360 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 MED27Q6P2C8 311 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 FRMD7Q6ZUT3 714 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 C10orf107Q8IVU9 208 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 LAS2Q8IYD9 372 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 AMER2Q8N7J2 671 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 TRPV3Q8NET8 790 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 OR51Q1Q8NH59 317 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 CREB3L4Q8TEY5 395 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 UBE2E3Q969T4 207 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 IMMP1LQ96LU5 166 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 ZNF354BQ96LW1 612 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 CDK15Q96Q40 435 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 MECRQ9BV79 373 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 SLC6A16Q9GZN6 736 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 VN1R1Q9GZP7 353 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 RHBGQ9H310 441 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 STK38LQ9Y2H1 464 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa15.6■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 A8MUI8 341 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 PPP6CO00743 305 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 CLEC3AO75596 197 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 ZWINTO95229 277 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 CLDN9O95484 217 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 B3GALT4O96024 378 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 SERPINA6P08185 405 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 CELA2AP08217 269 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 CAPN3P20807 821 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 SERPINB1P30740 379 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 NAGLUP54802 743 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 HYAL2Q12891 473 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 MINDY4Q4G0A6 757 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 MFSD4BQ5TF39 518 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 LANCL3Q6ZV70 420 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 CCNYL1Q8N7R7 359 aa15.59■□□□□ 0.09
NEK9-211ENST00000557673 OR7G3Q8NG95 312 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms