RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553628.1

AC009396.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009396.1, Length 1,079 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009396.1-201ENST00000553628 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 BTBD10Q9BSF8 475 aa4.71□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF577Q9BSK1 485 aa4.71□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 CENPOQ9BU64 300 aa4.71□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 A4GALTQ9NPC4 353 aa4.71□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa4.71□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 SCN1AP35498 2009 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 CASC3O15234 703 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 CLIC2O15247 247 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 AKAP3O75969 853 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 GAS8-AS1O95177 125 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 WDPCPO95876 746 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 NGFP01138 241 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 APOHP02749 345 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 NR2F1P10589 423 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 GNB3P16520 340 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 MX1P20591 662 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 CHRNB4P30926 498 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 P2RY2P41231 377 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 ATP12AP54707 1039 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 B3GALT5-AS1P59052 145 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 DMPKQ09013 629 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 BECN1Q14457 450 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 DCAF10Q5QP82 559 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 GARNL3Q5VVW2 1013 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 LPCAT2Q7L5N7 544 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF554Q86TJ5 538 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF383Q8NA42 475 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 RNF149Q8NC42 400 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 OR13J1Q8NGT2 312 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 CDHR1Q96JP9 859 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 DGAT2Q96PD7 388 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 TRIM9Q9C026 710 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 TRPV5Q9NQA5 729 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 FBXL5Q9UKA1 691 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 KCNJ14Q9UNX9 436 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 LRRK1Q38SD2 2015 aa4.7□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 MED13LQ71F56 2210 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 NID2Q14112 1375 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 K7EQS6 105 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 MAGEB2O15479 319 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 HMMRO75330 724 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 SERPINF2P08697 491 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 OR2T7P0C7T2 308 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 HLA-EP13747 358 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 ITGA3P26006 1051 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 TMOD1P28289 359 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 GABRR2P28476 465 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 NAPAP54920 295 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 RUNX3Q13761 415 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 KARSQ15046 597 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 BMP2KLQ5H9B9 411 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 CYP4A22Q5TCH4 519 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 SH2D5Q6ZV89 423 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 ERICH1Q86X53 443 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 CFAP61Q8NHU2 1237 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 TCEANC2Q96MN5 208 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 P2RY13Q9BPV8 354 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 LINC00597Q9H2U6 94 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 TRPV4Q9HBA0 871 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 EQTNQ9NQ60 294 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 PDZD2O15018 2839 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 NAV3Q8IVL0 2385 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 ZMYM6O95789 1325 aa4.69□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF197O14709 1029 aa4.68□□□□□ -1.66
AC009396.1-201ENST00000553628 MSH4O15457 936 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.6 ms