RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa12.96□□□□□ -0.33
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CS-231ENST00000552222 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa12.96□□□□□ -0.33
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CS-231ENST00000552222 H0YGG7 62 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 CLGNO14967 610 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP12.96□□□□□ -0.33
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CS-231ENST00000552222 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
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CS-231ENST00000552222 SIAH3Q8IW03 269 aa12.96□□□□□ -0.33
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CS-231ENST00000552222 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 ARL8AQ96BM9 186 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 MIEF2Q96C03 454 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 THAP11Q96EK4 314 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 L3HYPDHQ96EM0 354 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 FAM111AQ96PZ2 611 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 TMEM237Q96Q45 408 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 SELENOSQ9BQE4 189 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 AIF1LQ9BQI0 150 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 SPNS1Q9H2V7 528 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 MID2Q9UJV3 735 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 ABCA4P78363 2273 aa12.96□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 HCFC1P51610 2035 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 FEZF1A0PJY2 475 aa12.95□□□□□ -0.34
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CS-231ENST00000552222 MYBPHQ13203 477 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 CHIT1Q13231 466 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 MPP2Q14168 576 aa12.95□□□□□ -0.34
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CS-231ENST00000552222 PCOLCEQ15113 449 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 SYT16Q17RD7 645 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 UNC50Q53HI1 259 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 XKR6Q5GH73 641 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 TCTE1Q5JU00 501 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
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CS-231ENST00000552222 BEST3Q8N1M1 668 aa12.95□□□□□ -0.34
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CS-231ENST00000552222 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 NPAS2Q99743 824 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 EFCAB11Q9BUY7 163 aa12.95□□□□□ -0.34
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CS-231ENST00000552222 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 IPPKQ9H8X2 491 aa12.95□□□□□ -0.34
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CS-231ENST00000552222 OXSMQ9NWU1 459 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
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CS-231ENST00000552222 FITM1A5D6W6 292 aa12.94□□□□□ -0.34
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CS-231ENST00000552222 ASNA1O43681 348 aa12.94□□□□□ -0.34
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CS-231ENST00000552222 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 CXCR2P25025 360 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 SCTRP47872 440 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 ARSFP54793 590 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 NAGLUP54802 743 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 PRTGQ2VWP7 1150 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 WASHC2DQ5SRD0 308 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 VN1R4Q7Z5H5 301 aa12.94□□□□□ -0.34
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