RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 AIF1LQ9BQI0 150 aa11□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 TRIM54Q9BYV2 358 aa11□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 PELI2Q9HAT8 420 aa11□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 ZFP64Q9NPA5 681 aa11□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 MED16Q9Y2X0 877 aa11□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 DYRK1BQ9Y463 629 aa11□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 JMJD1CQ15652 2540 aa11□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 MAGEB16A2A368 324 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 NRDCO43847 1150 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 IL18BPO95998 194 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 CCL3P10147 92 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 TPSB2P20231 275 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 FPR1P21462 350 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 CTSSP25774 331 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 RNF4P78317 190 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 REEP5Q00765 189 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 SNX1Q13596 522 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 TPSAB1Q15661 275 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 PRUNE1Q86TP1 453 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 TTLQ8NG68 377 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 SLC22A8Q8TCC7 542 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 C1orf54Q8WWF1 131 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 GAL3ST3Q96A11 431 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 ARL15Q9NXU5 204 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 COPS7AQ9UBW8 275 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 CD8B2A6NJW9 211 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 B3GALT2O43825 422 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 ERN1O75460 977 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 C8BP07358 591 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 TNNI3P19429 210 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 SAT1P21673 171 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 GSTM2P28161 218 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 PPP2R1BP30154 601 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 ZNF136P52737 540 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 BTN3A2P78410 334 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 STX4Q12846 297 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 SERTAD2Q14140 314 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 POU4F3Q15319 338 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 MPEG1Q2M385 716 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 ZNF549Q6P9A3 640 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 GSTA5Q7RTV2 222 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 DENND6AQ8IWF6 608 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 RASGEF1CQ8N431 466 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 PAQR8Q8TEZ7 354 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 NEIL2Q969S2 332 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 PYCR2Q96C36 320 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 NTNG2Q96CW9 530 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 HES6Q96HZ4 224 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 CAPZA3Q96KX2 299 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 SLC6A15Q9H2J7 730 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 TAS2R13Q9NYV9 303 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 CNIH4Q9P003 139 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 VTI1BQ9UEU0 232 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 NDRG3Q9UGV2 375 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 HIVEP2P31629 2446 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 SH3D21A4FU49 640 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 DYRK3O43781 588 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 CTNSO60931 367 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 FTCDO95954 541 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 PIGAP37287 484 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 SLC1A2P43004 574 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 TBCELQ5QJ74 424 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 POMZP3Q6PJE2 187 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 TMPRSS11BQ86T26 416 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 KIAA1328Q86T90 577 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 VWA5B2Q8N398 1253 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 SLC15A4Q8N697 577 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 ANKRD53Q8N9V6 530 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 FAM47BQ8NA70 645 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 NUBPLQ8TB37 319 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 KIAA1191Q96A73 305 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 FBXL8Q96CD0 374 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 OR4K3Q96R72 315 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 OR8D2Q9GZM6 311 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-228ENST00000551473 LACRTQ9GZZ8 138 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms