RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINB7	O75635	380 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDH8	O95206	1070 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	ARAF	P10398	606 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	CEACAM1	P13688	526 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	RHCE	P18577	417 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	NUDT1	P36639	197 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	MAPK12	P53778	367 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	CDK6	Q00534	326 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	PLIN5	Q00G26	463 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	SPIDR	Q14159	915 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRC32	Q14392	662 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	NFE2L1	Q14494	772 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	GTDC1	Q4AE62	458 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	AGBL4	Q5VU57	503 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	REEP3	Q6NUK4	255 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM64	Q6YI46	380 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	CHPF	Q8IZ52	775 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	PARP8	Q8N3A8	854 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	THAP11	Q96EK4	314 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	PDXP	Q96GD0	296 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	FBXL20	Q96IG2	436 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	NODAL	Q96S42	347 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF607	Q96SK3	696 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	GABRG3	Q99928	467 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	EDEM2	Q9BV94	578 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	DUSP21	Q9H596	190 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	KRT84	Q9NSB2	600 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	SNX7	Q9UNH6	387 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	USP22	Q9UPT9	525 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	ITM2B	Q9Y287	266 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	ITPR1	Q14643	2758 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	IGLON5	A6NGN9	336 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442		E9PQ18	207 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442		K7ESF4	209 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442		K7ESM1	405 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	PLOD2	O00469	737 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	DNTT	P04053	509 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	KLK1	P06870	262 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	IFI6	P09912	130 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	HLA-E	P13747	358 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	CCNA2	P20248	432 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	NTSR1	P30989	418 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC5A2	P31639	672 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	DRD3	P35462	400 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	MPL	P40238	635 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	CRAT	P43155	626 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TAS2R50	P59544	299 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	KIAA1024L	P59773	190 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	HBA1	P69905	142 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNJ10	P78508	379 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	CDK5R2	Q13319	367 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	SCARB2	Q14108	478 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	NKG7	Q16617	165 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	PYCR3	Q53H96	274 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	SFXN5	Q8TD22	340 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	GIPC3	Q8TF64	312 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	MBOAT4	Q96T53	435 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		11.25	□□□□□ -0.61

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