RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541456.1

PRR4-209, Transcript of proline rich 4, human

TSL 3

Gene PRR4, Length 454 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR4-209	ENST00000541456	CDKL1	Q00532	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	PDE1B	Q01064	536 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TFF2	Q03403	129 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	FGL1	Q08830	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	HYAL1	Q12794	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TRIP10	Q15642	601 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456		Q5PR19	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	LGI2	Q8N0V4	545 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TRPV3	Q8NET8	790 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	SEPT8	Q92599	483 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TMEM45B	Q96B21	275 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	LRRC39	Q96DD0	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	COQ2	Q96H96	371 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	NPY6R	Q99463	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456		A0A1W2PRB8	838 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	SLC22A2	O15244	555 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ADAM12	O43184	909 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	FCMR	O60667	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	UFL1	O94874	794 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	IGHE	P01854	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CHRNA1	P02708	482 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	KCNJ4	P48050	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	HERVK_113	P63132	956 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ERVK-8	P63133	956 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	NUCB2	P80303	420 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	SPHAR	Q15513	63 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	HKDC1	Q2TB90	917 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	PIGT	Q969N2	578 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	EME1	Q96AY2	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms