RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 BCL7AQ4VC05 210 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 GPR153Q6NV75 609 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 CNKSR3Q6P9H4 555 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 MRGPRX2Q96LB1 330 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRD-214ENST00000540109 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRD-214ENST00000540109 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRD-214ENST00000540109 ZNF175Q9Y473 711 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRD-214ENST00000540109 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
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PTPRD-214ENST00000540109 HID1Q8IV36 788 aa5.82□□□□□ -1.48
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PTPRD-214ENST00000540109 AKR7LQ8NHP1 331 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 KLHL5Q96PQ7 755 aa5.82□□□□□ -1.48
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PTPRD-214ENST00000540109 B4GAT1O43505 415 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 BNIP3LO60238 219 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 GADD45AP24522 165 aa5.82□□□□□ -1.48
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PTPRD-214ENST00000540109 MMP12P39900 470 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
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