RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 FSD1LQ9BXM9 530 aa8.47□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.47□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 BABAM2Q9NXR7 383 aa8.47□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 QSOX1O00391 747 aa8.47□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 S100A8P05109 93 aa8.47□□□□□ -1.05
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GPBP1-208ENST00000514387 PTPRAP18433 802 aa8.47□□□□□ -1.05
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GPBP1-208ENST00000514387 SLC26A5P58743 744 aa8.47□□□□□ -1.05
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GPBP1-208ENST00000514387 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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GPBP1-208ENST00000514387 OR2M2Q96R28 347 aa8.47□□□□□ -1.05
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GPBP1-208ENST00000514387 MED28Q9H204 178 aa8.47□□□□□ -1.05
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GPBP1-208ENST00000514387 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.47□□□□□ -1.05
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GPBP1-208ENST00000514387 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
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GPBP1-208ENST00000514387 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
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GPBP1-208ENST00000514387 INPPL1O15357 1258 aa8.46□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 FABP7O15540 132 aa8.46□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 PMPCBO75439 489 aa8.46□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 PEPDP12955 493 aa8.46□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 CRYBB2P43320 205 aa8.46□□□□□ -1.06
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