RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 VAC14Q08AM6 782 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF763Q0D2J5 394 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 CA13Q8N1Q1 262 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 OR5T3Q8NGG3 340 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 OR51Q1Q8NH59 317 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 CCT8L2Q96SF2 557 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 MS4A12Q9NXJ0 267 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 ASIC5Q9NY37 505 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 TRPC4Q9UBN4 977 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 DAPP1Q9UN19 280 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 TRIM33Q9UPN9 1127 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 SSUH2Q9Y2M2 353 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 COL6A6A6NMZ7 2263 aa18.97■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 C9J4A7 227 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 ERVH48-1M5A8F1 160 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 UBDO15205 165 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 SNX3O60493 162 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 FAM107AO95990 144 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 PRB1P04280 392 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 BCKDHAP12694 445 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 SDC1P18827 310 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 ITGAXP20702 1163 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 CPN2P22792 545 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 LIM2P55344 173 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 RAB38P57729 211 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 RHDQ02161 417 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 RUNX2Q13950 521 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 MAP7Q14244 749 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 GPR180Q86V85 440 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 FAM9CQ8IZT9 166 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 LIX1Q8N485 282 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 ESX1Q8N693 406 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 C16orf78Q8WTQ4 265 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 C10orf82Q8WW14 230 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 WDR41Q9HAD4 459 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 WDR70Q9NW82 654 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 ACSL6Q9UKU0 697 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 PADI1Q9ULC6 663 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC88CQ9P219 2028 aa18.96■□□□□ 0.63
SMIM20-201ENST00000506197 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 ASMTP46597 345 aa18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 TAS2R50P59544 299 aa18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 RPS6KA2Q15349 733 aa18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 SYT16Q17RD7 645 aa18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 NLGN4XQ8N0W4 816 aa18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 PEX11GQ96HA9 241 aa18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 FAIM2Q9BWQ8 316 aa18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 SPRY4Q9C004 299 aa18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 AIG1Q9NVV5 245 aa18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 ASB4Q9Y574 426 aa18.95■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 K7ENP7 123 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 RAD1O60671 282 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 DNAJB6O75190 326 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 ONECUT2O95948 504 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 NR2F6P10588 404 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 G6PDP11413 515 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 IDO1P14902 403 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 PCSK2P16519 638 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 IL10P22301 178 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 XCR1P46094 333 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 DIO3P55073 304 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 STX1BP61266 288 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 TNFRSF17Q02223 184 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 OCA2Q04671 838 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 GSTA3Q16772 222 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 MLIPQ5VWP3 458 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM198Q66K66 360 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC81Q6ZN84 652 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 IKBIPQ70UQ0 350 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 COX15Q7KZN9 410 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 OVCH1Q7RTY7 1134 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 FAM47BQ8NA70 645 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 CLHC1Q8NHS4 586 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 FKBP10Q96AY3 582 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 TM4SF18Q96CE8 201 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 MARK4Q96L34 752 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 CATSPER2Q96P56 530 aa18.94■□□□□ 0.62
SMIM20-201ENST00000506197 TSSK3Q96PN8 268 aa18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms