RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 CD72P21854 359 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 CRATP43155 626 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 NR1H2P55055 460 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 VLDLRP98155 873 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 EPS8Q12929 822 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 CRB2Q5IJ48 1285 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM40Q6P9F5 258 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ADCK2Q7Z695 626 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 VTCN1Q7Z7D3 282 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4E2Q8NGC2 313 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 GPBAR1Q8TDU6 330 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 LCN9Q8WX39 176 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 NCSTNQ92542 709 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 UCN3Q969E3 161 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 MAL2Q969L2 176 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 NEURL3Q96EH8 262 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 NRBF2Q96F24 287 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 DOHHQ9BU89 302 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 TOR3AQ9H497 397 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 CAAP1Q9H8G2 361 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM118AQ9NWS6 357 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 EHD3Q9NZN3 535 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ACSL6Q9UKU0 697 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 DMTF1Q9Y222 760 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 E9PQ18 207 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 MAN2B1O00754 1011 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SUV39H1O43463 412 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 RASGRP1O95267 797 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 BMP10O95393 424 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 CLIC3O95833 236 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 TNFP01375 233 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 F3P13726 295 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 FPR1P21462 350 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 PRKACGP22612 351 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 GRK3P35626 688 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ACTR1BP42025 376 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 RABIFP47224 123 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 DGKEP52429 567 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 PLA2G16P53816 162 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ITGA1P56199 1179 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ACTR1AP61163 376 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SELENOWP63302 87 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SCARB2Q14108 478 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 KIR2DS3Q14952 304 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 UBXN2BQ14CS0 331 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 NADK2Q4G0N4 442 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 TTC23Q5W5X9 447 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXO42Q6P3S6 717 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 BORAQ6PGQ7 559 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SPESP1Q6UW49 350 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 Q6ZS52 159 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 CEP68Q76N32 757 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SYT13Q7L8C5 426 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 RD3Q7Z3Z2 195 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 VN1R4Q7Z5H5 301 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SATL1Q86VE3 508 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 CYP4Z1Q86W10 505 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF130Q86XS8 419 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC30A8Q8IWU4 369 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D19Q8N5T2 526 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2L5Q8NG80 312 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 OR13H1Q8NG92 308 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 NT5CQ8TCD5 201 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 HMGB4Q8WW32 186 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 TAMM41Q96BW9 452 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 TM4SF19Q96DZ7 209 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2A14Q96R47 310 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ORAI3Q9BRQ5 295 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 NLNQ9BYT8 704 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ADPRHL2Q9NX46 363 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 KLK4Q9Y5K2 254 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SNX11Q9Y5W9 270 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A087WXM4 84 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PR48 441 aa10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms