RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 FUT11Q495W5 492 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 SLC39A12Q504Y0 691 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 KLHL22Q53GT1 634 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF789Q5FWF6 425 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 ARMCX4Q5H9R4 360 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 NHLRC1Q6VVB1 395 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 LSMEM2Q8N112 164 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 DDHD1Q8NEL9 900 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 LPCAT1Q8NF37 534 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM58Q8NG06 486 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 PSMA8Q8TAA3 256 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 SNX21Q969T3 373 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 RFT1Q96AA3 541 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 LGALS12Q96DT0 336 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 CABS1Q96KC9 395 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 PANX3Q96QZ0 392 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 PI4K2AQ9BTU6 479 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 FUCA2Q9BTY2 467 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 SPG21Q9NZD8 308 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 POLKQ9UBT6 870 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 SELENOKQ9Y6D0 94 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 SCN9AQ15858 1988 aa3.8□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 ECM29Q5VYK3 1845 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 CDHR2Q9BYE9 1310 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 PRR23AA6NEV1 266 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 ANTXRLA6NF34 631 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 MSGN1A6NI15 193 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 GRID2O43424 1007 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 SCO2O43819 266 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 CYTIPO60759 359 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 KERAO60938 352 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 GRAP2O75791 330 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 MT-ND2P03891 347 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 TPM2P07951 284 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 EZRP15311 586 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 GNB3P16520 340 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 EPS15P42566 896 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 XGP55808 180 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 FKBP1BP68106 108 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 SLC34A1Q06495 639 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 AP1B1Q10567 949 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 PPA1Q15181 289 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 RPS6KA1Q15418 735 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 ACKR1Q16570 336 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 C2orf76Q3KRA6 126 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 BHLHB9Q6PI77 547 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 DHRS11Q6UWP2 260 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 OLFM4Q6UX06 510 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 MACC1Q6ZN28 852 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 C5orf24Q7Z6I8 188 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 SIAH3Q8IW03 269 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 AMER3Q8N944 861 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF248Q8NDW4 579 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 OR6S1Q8NH40 331 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 MRGPRDQ8TDS7 321 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 LRR1Q96L50 414 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 ACAT2Q9BWD1 397 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 OSBPL8Q9BZF1 889 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 C3orf14Q9HBI5 128 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 EXOC1Q9NV70 894 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 PANK4Q9NVE7 773 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 PLCL2Q9UPR0 1127 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 TMED7Q9Y3B3 224 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 OTOFQ9HC10 1997 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 PFASO15067 1338 aa3.78□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 MAGEB16A2A368 324 aa3.78□□□□□ -1.8
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC162PA2VCL2 907 aa3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms