RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	CCDC120	Q96HB5	630 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	COQ10A	Q96MF6	247 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF583	Q96ND8	569 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	C5orf51	A6NDU8	294 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	CD8B2	A6NJW9	211 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	CD8B	P10966	210 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	LAMP1	P11279	417 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	NT5E	P21589	574 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	MAGEA12	P43365	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	NRIP1	P48552	1158 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	CPZ	Q66K79	652 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	GPR150	Q8NGU9	434 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	EPYC	Q99645	322 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	NEURL2	Q9BR09	285 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	TNFRSF10A	O00220	468 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	AOC2	O75106	756 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	SLC25A12	O75746	678 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	MPI	P34949	423 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	KCTD11	Q693B1	232 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	MTG2	Q9H4K7	406 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	DISC1	C4P0D8	188 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574		M0R129	80 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	ICMT	O60725	284 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	JUP	P14923	745 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	KEL	P23276	732 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	OR5J2	Q8NH18	312 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	CD180	Q99467	661 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	EXO5	Q9H790	373 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	NANS	Q9NR45	359 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	CIT	O14578	2027 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PKD1-222	ENST00000496574	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	OSM	P13725	252 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	HSD3B1	P14060	373 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	HSD3B2	P26439	372 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	BDKRB1	P46663	353 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	MTNR1A	P48039	350 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	MAN2A2	P49641	1150 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	CDK10	Q15131	360 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	SERPINA11	Q86U17	422 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	SPERT	Q8NA61	448 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	THAP6	Q8TBB0	222 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	GGH	Q92820	318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	MED30	Q96HR3	178 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	PAH	P00439	452 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	UQCRC2	P22695	453 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	LHCGR	P22888	699 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	PIGA	P37287	484 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	HK3	P52790	923 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	SELENOW	P63302	87 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	OR8K5	Q8NH50	307 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	CD200R1	Q8TD46	325 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	RGMA	Q96B86	450 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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