RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa4.36□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 ARL5AQ9Y689 179 aa4.36□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 A0A0G2JNG1 304 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 MAGEB16A2A368 324 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 PDZK1P1A8MUH7 402 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 B4E171 279 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 AP4M1O00189 453 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 UGT1A9O60656 530 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 ZWINTO95229 277 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 MT-CO3P00414 261 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 SOD1P00441 154 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 VIPP01282 170 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 MT-ND3P03897 115 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 ABHD2P08910 425 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 GIMD1P0DJR0 217 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 ACP5P13686 325 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 ETS1P14921 441 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 UGT1A6P19224 532 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 UGT1A1P22309 533 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 UGT1A4P22310 534 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 AK4P27144 223 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 GABRB3P28472 473 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 ALDH4A1P30038 563 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 RPL22P35268 128 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 UGT1A3P35503 534 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 UGT1A5P35504 534 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 TSPAN7P41732 249 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 MSH2P43246 934 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 PRAMEP78395 509 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 CDK16Q00536 496 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 CACNG1Q06432 222 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 GPS1Q13098 491 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 PRKG2Q13237 762 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 RAB32Q13637 225 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 KRT33BQ14525 404 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 KIR2DS5Q14953 304 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 MORF4L2Q15014 288 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 CHRNA6Q15825 494 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 KYNUQ16719 465 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 C14orf28Q4W4Y0 310 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 HES3Q5TGS1 186 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 KCTD11Q693B1 232 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 TTC27Q6P3X3 843 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 CASC4Q6P4E1 433 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 ANKRD16Q6P6B7 361 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 TMEM220Q6QAJ8 160 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 C6orf89Q6UWU4 347 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 AMZ2Q86W34 360 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 SLC35F3Q8IY50 421 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 IZUMO1Q8IYV9 350 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 LSMEM2Q8N112 164 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 ARHGAP24Q8N264 748 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 PELI3Q8N2H9 469 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 TTC30BQ8N4P2 665 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 OR52K1Q8NGK4 314 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 CCL4L1Q8NHW4 92 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 PYROXD1Q8WU10 500 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 CKAP2Q8WWK9 683 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 EID2BQ96D98 161 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 PRR25Q96S07 402 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 COPS8Q99627 209 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 CCDC3Q9BQI4 270 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 TIMM29Q9BSF4 260 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 TSSK1BQ9BXA7 367 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 STRADBQ9C0K7 418 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 IL22Q9GZX6 179 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 CHST8Q9H2A9 424 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 UGT1A7Q9HAW7 530 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 UGT1A10Q9HAW8 530 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 UGT1A8Q9HAW9 530 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 IL26Q9NPH9 171 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa4.35□□□□□ -1.71
RBM39-240ENST00000495293 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms