RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492407.1

HDAC3-212, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC3, Length 782 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-212ENST00000492407 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 CYS1Q717R9 158 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 TMPRSS11BQ86T26 416 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 OR2L5Q8NG80 312 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 OR5L2Q8NGL0 311 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 RND1Q92730 232 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.5□□□□□ -1.05
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HDAC3-212ENST00000492407 MS4A6EQ96DS6 147 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 WDR34Q96EX3 536 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 SGCZQ96LD1 299 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 QRFPRQ96P65 431 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 SERINC2Q96SA4 455 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 SCN2AQ99250 2005 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 EFCAB11Q9BUY7 163 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 RHBGQ9H310 441 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 KLHL31Q9H511 634 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 MOCS1Q9NZB8 636 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 MYOTQ9UBF9 498 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 FBXW2Q9UKT8 454 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 CLDN16Q9Y5I7 305 aa8.5□□□□□ -1.05
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HDAC3-212ENST00000492407 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 A0A1B0GVC2 190 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 A8MVJ9 347 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 ACOT7O00154 380 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 CDC7O00311 574 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 CYR61O00622 381 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 BCKDKO14874 412 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 ERI3O43414 337 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 B3GALT4O96024 378 aa8.49□□□□□ -1.05
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HDAC3-212ENST00000492407 CNR1P21554 472 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 SERPINB1P30740 379 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 HNF4AP41235 474 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 NEK2P51955 445 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 MTTPP55157 894 aa8.49□□□□□ -1.05
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HDAC3-212ENST00000492407 PCDH1Q08174 1060 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 SLC13A2Q13183 592 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 LAPTM5Q13571 262 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 E2F2Q14209 437 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 TBCCQ15814 346 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 HYAL4Q2M3T9 481 aa8.49□□□□□ -1.05
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HDAC3-212ENST00000492407 FRA10AC1Q70Z53 315 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 MDGA2Q7Z553 956 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.49□□□□□ -1.05
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HDAC3-212ENST00000492407 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 OR14A16Q8NHC5 309 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 NCLNQ969V3 563 aa8.49□□□□□ -1.05
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HDAC3-212ENST00000492407 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.49□□□□□ -1.05
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HDAC3-212ENST00000492407 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 DERL2Q9GZP9 239 aa8.49□□□□□ -1.05
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HDAC3-212ENST00000492407 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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HDAC3-212ENST00000492407 LYRM4Q9HD34 91 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 KCNJ16Q9NPI9 418 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 HPF1Q9NWY4 346 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 IKZF3Q9UKT9 509 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 DAPP1Q9UN19 280 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 ERVK-11Q9UQG0 969 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 TMEM200CA6NKL6 621 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 A8MUA0 341 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 C4orf51C9J302 202 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 E7ESA3 106 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 HS6ST1O60243 411 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 SUSD5O60279 629 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-212ENST00000492407 TOXO94900 526 aa8.48□□□□□ -1.05
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